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TriangleCountingUndirected

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2023-12-01

TriangleCountUndirected

1. 算法介绍

TriangleCountUndirected是计算每个Graph中节点所在的三角形个数的算法。

2. 运行

算法IO参数

  • input:输入,hdfs路径,无向图,不带权。每行表示一条边: srcId 分隔符 dstId
  • output: 输出,hdfs路径。每行表示一个顶点及其对应的三角形个数和局部聚集系数(如果computeLCC为true):
    • 当computeLCC为true时, 输出为3列(tab间隔):nodeId tab 三角形个数 tab 局部聚集系数
    • 当computeLCC为false时, 输出为2列(tab间隔):nodeId tab 三角形个数
  • sep: 分隔符,输入中每条边的起始顶点、目标顶点之间的分隔符: tab, 空格

算法参数

  • partitionNum:数据分区数,spark rdd数据的分区数量
  • psPartitionNum:参数服务器上模型的分区数量
  • batchSize: 向ps推送邻接表时的mini batch大小
  • pullBatchSize: 计算顶点的三角形个数时的mini batch大小(每次计算pullBatchSize个顶点)
  • computeLCC: 是否同时计算顶点的局部聚集系数
  • storageLevel:RDD存储级别,DISK_ONLY/MEMORY_ONLY/MEMORY_AND_DISK

资源参数

  • ps个数和内存大小:ps.instance与ps.memory的乘积是ps总的配置内存。为了保证Angel不挂掉,需要配置ps上数据存储量大小两倍左右的内存。对于三角计数来说,ps上放置的是各顶点的一阶邻居,内存大小可以按照边数进行估算。
  • Spark的资源配置:num-executors与executor-memory的乘积是executors总的配置内存,最好能存下2倍的输入数据。 如果内存紧张,1倍也是可以接受的,但是相对会慢一点。 比如说100亿的边集大概有160G大小, 20G * 20 的配置是足够的。 在资源实在紧张的情况下, 尝试加大分区数目!

任务提交示例

input=hdfs://my-hdfs/data
output=hdfs://my-hdfs/output

source ./spark-on-angel-env.sh
$SPARK_HOME/bin/spark-submit \
  --master yarn-cluster\
  --conf spark.ps.instances=1 \
  --conf spark.ps.cores=1 \
  --conf spark.ps.jars=$SONA_ANGEL_JARS \
  --conf spark.ps.memory=10g \
  --name "hindex angel" \
  --jars $SONA_SPARK_JARS  \
  --driver-memory 5g \
  --num-executors 1 \
  --executor-cores 4 \
  --executor-memory 10g \
  --class org.apache.spark.angel.examples.graph.TriangleCountUndirectedExample \
  ../lib/spark-on-angel-examples-3.2.0.jar
  input:$input output:$output sep:tab storageLevel:MEMORY_ONLY useBalancePartition:true \
  partitionNum:4 psPartitionNum:1 batchSize:3000 pullBatchSize:1000 computeLCC:false

常见问题

  • 在差不多10min的时候,任务挂掉: 很可能的原因是angel申请不到资源!由于该三角计数的实现是基于Spark On Angel开发,实际上涉及到Spark和Angel两个系统,在向Yarn申请资源时是独立进行的。 在Spark任务拉起之后,由Spark向Yarn提交Angel的任务,如果不能在给定时间内申请到资源,就会报超时错误,任务挂掉! 解决方案是: 1)确认资源池有足够的资源 2) 添加spakr conf: spark.hadoop.angel.am.appstate.timeout.ms=xxx 调大超时时间,默认值为600000,也就是10分钟

项目地址:https://github.com/Angel-ML/angel
官网:https://angelml.ai/