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ConnectedComponents

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2023-12-01

CC

CC(connected components)算法用于求解图的弱连通分量。

1. 算法介绍

CC算法将图看作无向图,对在同一个连通分量中的节点,分配一个相同的标签。 我们基于Spark On Angel实现了大规模网络上的弱连通分量算法。 其中ps维护节点的最新的节点的标签值,Spark端维护网络的邻接表。 每轮根据节点邻居标签对节点进行更新。直到无节点需要更新标签时终止。 每个连通分量有一个单独的标签。 本实现方案结合分布式的大数据处理优势与单机并查集算法运算快速的优势, 将连通分量的处理拆分成分布式以及单机并查集处理两部分,并在最后将两部分的结果合并成最终结果。

2. 运行

参数

IO参数

  • input: hdfs路径,输入网络数据,每行两个长整形id表示的节点,以空白符,制表符或者逗号分隔,表示一条边
  • output: hdfs路径, 输出节点对应的标签值, 每行一条数据,表示节点对应的标签值,以tap符分割
  • sep: 分隔符,输入中每条边的起始顶点、目标顶点之间的分隔符: tab, 空格, 逗号

算法参数

  • partitionNum: 输入数据分区数
  • psPartitionNum:参数服务器上模型的分区数量
  • storageLevel:RDD存储级别,DISK_ONLY/MEMORY_ONLY/MEMORY_AND_DISK
  • localLimit: 单机处理的图的最大边数,当对图的规模预估大小小于此值时,将计算转入local单机计算
  • compressIterNum: 分布式每运行compressIterNum轮迭代,就检测一下剩余部分是否可以转入单机运算
  • needReplicaEdge: 是否需要将边进行反向构造无向图

资源参数

  • ps个数和内存大小:ps.instance与ps.memory的乘积是ps总的配置内存。为了保证Angel不挂掉,需要配置ps上数据存储量大小两倍左右的内存。
  • Spark的资源配置:num-executors与executor-memory的乘积是executors总的配置内存,最好能存下2倍的输入数据。 如果内存紧张,1倍也是可以接受的,但是相对会慢一点。 比如说100亿的边集大概有160G大小, 20G * 20 的配置是足够的。 在资源实在紧张的情况下, 尝试加大分区数目!

任务提交示例

input=hdfs://my-hdfs/data
output=hdfs://my-hdfs/output

source ./spark-on-angel-env.sh
$SPARK_HOME/bin/spark-submit \
  --master yarn-cluster\
  --conf spark.ps.instances=1 \
  --conf spark.ps.cores=1 \
  --conf spark.ps.jars=$SONA_ANGEL_JARS \
  --conf spark.ps.memory=10g \
  --name "cc angel" \
  --jars $SONA_SPARK_JARS  \
  --driver-memory 5g \
  --num-executors 1 \
  --executor-cores 4 \
  --executor-memory 10g \
  --class org.apache.spark.angel.examples.graph.CCExample \
  ../lib/spark-on-angel-examples-3.1.0.jar
  input:$input output:$output sep:tab storageLevel:MEMORY_ONLY useBalancePartition:true \
  partitionNum:4 psPartitionNum:1 localLimit:100000000 compressIterNum:3 needReplicaEdge:true

常见问题

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项目地址:https://github.com/Angel-ML/angel
官网:https://angelml.ai/