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十三、预测

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2023-12-01

数据科学的一个重要方面,是发现数据可以告诉我们什么未来的事情。气候和污染的数据说了几十年内温度的什么事情?根据一个人的互联网个人信息,哪些网站可能会让他感兴趣?病人的病史如何用来判断他或她对治疗的反应?

为了回答这样的问题,数据科学家已经开发出了预测的方法。在本章中,我们将研究一种最常用的方法,基于一个变量的值来预测另一个变量。

方法的基础由弗朗西斯·高尔顿爵士(Sir Francis Galton)奠定。我们在 7.1 节看到,高尔顿研究了身体特征是如何从一代传到下一代的。他最著名的工作之一,是根据父母的高度预测子女的身高。我们已经研究了高尔顿为此收集的数据集。heights表包含了 934 个成年子女的双亲身高和子女身高(全部以英寸为单位)。

# Galton's data on heights of parents and their adult children
galton = Table.read_table('galton.csv')
heights = Table().with_columns(
    'MidParent', galton.column('midparentHeight'),
    'Child', galton.column('childHeight')
    )
heights
MidParentChild
75.4373.2
75.4369.2
75.4369
75.4369
73.6673.5
73.6672.5
73.6665.5
73.6665.5
72.0671
72.0668

(省略了 924 行)

heights.scatter('MidParent')

收集数据的主要原因是能够预测成年子女的身高,他们的父母与数据集中相似。 在注意到两个变量之间的正相关之后,我们在第 7.1 节中做了这些预测。

我们的方法是,基于新人的双亲身高周围的所有点来做预测。 为此,我们编写了一个名为predict_child的函数,该函数以双亲身高作为参数,并返回双亲身高在半英寸之内的,所有子女的平均身高。

def predict_child(mpht):
    """Return a prediction of the height of a child 
    whose parents have a midparent height of mpht.
    
    The prediction is the average height of the children 
    whose midparent height is in the range mpht plus or minus 0.5 inches.
    """

    close_points = heights.where('MidParent', are.between(mpht-0.5, mpht + 0.5))
    return close_points.column('Child').mean()              

我们将函数应用于Midparent列,可视化我们的结果。

# Apply predict_child to all the midparent heights

heights_with_predictions = heights.with_column(
    'Prediction', heights.apply(predict_child, 'MidParent')
    )
# Draw the original scatter plot along with the predicted values

heights_with_predictions.scatter('MidParent')

给定双亲身高的预测值,大致位于给定身高处的垂直条形的中心。这种预测方法称为回归。 本章后面我们会看到这个术语的来源。 我们也会看到,我们是否可以避免将“接近”任意定义为“在半英寸之内”。 但是首先我们要开发一个可用于很多环境的方法,来决定一个变量作为另一个变量的预测值有多好。

相关性

在本节中,我们将开发一种度量,度量散点图紧密聚集在一条直线上的程度。 形式上,这被称为测量线性关联。

hybrid表包含了 1997 年到 2013 年在美国销售的混合动力车的数据。数据来自佛罗里达大学 Larry Winner 教授的在线数据档案。这些列为:

  • vehicle:车的型号
  • year:出厂年份
  • msrp: 2013 年制造商的建议零售价(美元)
  • acceleration: 加速度(千米每小时每秒)
  • mpg: 燃油效率(英里每加仑)
  • class: 型号的类别

(省略了 143 行)

下图是msrpacceleration的散点图。 这意味着msrp绘制在纵轴上并且acceleration在横轴上。

hybrid.scatter('acceleration', 'msrp')

注意正相关。 散点图倾斜向上,表明加速度较大的车辆通常成本更高;相反,价格更高的汽车通常具有更大的加速。

msrpmpg的散点图表明了负相关。 mpg较高的混合动力车往往成本较低。 这似乎令人惊讶,直到你明白了,加速更快的汽车往往燃油效率更低,行驶里程更低。 之前的散点图显示,这些也是价格更高的车型。

hybrid.scatter('mpg', 'msrp')

除了负相关,价格与效率的散点图显示了两个变量之间的非线性关系。 这些点似乎围绕在一条曲线周围,而不是一条直线。

但是,如果我们只将数据限制在 SUV 类别中,价格和效率之间仍然负相关的,但是这种关系似乎更为线性。 SUV 价格与加速度之间的关系也呈线性趋势,但是斜率是正的。

suv = hybrid.where('class', 'SUV')
suv.scatter('mpg', 'msrp')

suv.scatter('acceleration', 'msrp')

你会注意到,即使不关注变量被测量的单位,我们也可以从散点图的大体方向和形状中得到有用的信息。

事实上,我们可以将所有的变量绘制成标准单位,并且绘图看起来是一样的。 这给了我们一个方法,来比较两个散点图中的线性程度。

回想一下,在前面的章节中,我们定义了standard_units函数来将数值数组转换为标准单位。

def standard_units(any_numbers):
    "Convert any array of numbers to standard units."
    return (any_numbers - np.mean(any_numbers))/np.std(any_numbers)  

我们可以使用这个函数重新绘制 SUV 的两个散点图,所有变量都以标准单位测量。

Table().with_columns(
    'mpg (standard units)',  standard_units(suv.column('mpg')), 
    'msrp (standard units)', standard_units(suv.column('msrp'))
).scatter(0, 1)
plots.xlim(-3, 3)
plots.ylim(-3, 3);

Table().with_columns(
    'acceleration (standard units)', standard_units(suv.column('acceleration')), 
    'msrp (standard units)',         standard_units(suv.column('msrp'))
).scatter(0, 1)
plots.xlim(-3, 3)
plots.ylim(-3, 3);

我们在这些数字中看到的关联与我们之前看到的一样。 另外,由于现在两张散点图的刻度完全相同,我们可以看到,第二张图中的线性关系比第一张图中的线性关系更加模糊。

我们现在将定义一个度量,使用标准单位来量化我们看到的这种关联。

相关系数

相关系数测量两个变量之间线性关系的强度。 在图形上,它测量散点图聚集在一条直线上的程度。

相关系数这个术语不容易表述,所以它通常缩写为相关性并用r表示。

以下是一些关于r的数学事实,我们将通过模拟观察。

  • 相关系数r是介于-11之间的数字。
  • r度量了散点图围绕一条直线聚集的程度。
  • 如果散点图是完美的向上倾斜的直线,r = 1,如果散点图是完美的向下倾斜的直线,r = -1

函数r_scatter接受r值作为参数,模拟相关性非常接近r的散点图。 由于模拟中的随机性,相关性不会完全等于r

调用r_scatter几次,以r的不同值作为参数,并查看散点图如何变化。

r = 1时,散点图是完全线性的,向上倾斜。 当r = -1时,散点图是完全线性的,向下倾斜。 当r = 0时,散点图是围绕水平轴的不定形云,并且变量据说是不相关的。

r_scatter(0.9)

r_scatter(0.25)

r_scatter(0)

r_scatter(-0.55)

计算r

目前为止,r的公式还不清楚。 它拥有超出本课程范围的数学基础。 然而,你将会看到,这个计算很简单,可以帮助我们理解r的几个属性。

r的公式:

r是两个变量的乘积的均值,这两个变量都以标准单位来衡量。

以下是计算中的步骤。 我们将把这些步骤应用于xy值的简单表格。

x = np.arange(1, 7, 1)
y = make_array(2, 3, 1, 5, 2, 7)
t = Table().with_columns(
        'x', x,
        'y', y
    )
t
xy
12
23
31
45
52
67

根据散点图,我们预计r将是正值,但不等于 1。

t.scatter(0, 1, s=30, color='red')

第一步:将每个变量转换为标准单位。

t_su = t.with_columns(
        'x (standard units)', standard_units(x),
        'y (standard units)', standard_units(y)
    )
t_su
xyx (standard units)y (standard units)
12-1.46385-0.648886
23-0.87831-0.162221
31-0.29277-1.13555
450.292770.811107
520.87831-0.648886
671.463851.78444

第二步:将每一对标准单位相乘

t_product = t_su.with_column('product of standard units', t_su.column(2) * t_su.column(3))
t_product
xyx (standard units)y (standard units)product of standard units
12-1.46385-0.6488860.949871
23-0.87831-0.1622210.142481
31-0.29277-1.135550.332455
450.292770.8111070.237468
520.87831-0.648886-0.569923
671.463851.784442.61215

第三步:r是第二步计算的乘积的均值。

# r is the average of the products of standard units

r = np.mean(t_product.column(4))
r
0.61741639718977093

正如我们的预期,r是个不等于的正值。

r的性质

计算结果表明:

r是一个纯数字。 它没有单位。 这是因为r基于标准单位。 r不受任何轴上单位的影响。 这也是因为r基于标准单位。 r不受轴的交换的影响。 在代数上,这是因为标准单位的乘积不依赖于哪个变量被称为xy。 在几何上,轴的切换关于y = x直线翻转了散点图,但不会改变群聚度和关联的符号。

t.scatter('y', 'x', s=30, color='red')

correlation函数

我们将要重复计算相关性,所以定义一个函数会有帮助,这个函数通过执行上述所有步骤来计算它。 让我们定义一个函数correlation,它接受一个表格,和两列的标签。该函数返回r,它是标准单位下这些列的值的乘积的平均值。

def correlation(t, x, y):
    return np.mean(standard_units(t.column(x))*standard_units(t.column(y)))

让我们在txy列上调用函数。 该函数返回xy之间的相关性的相同答案,就像直接应用r的公式一样。

correlation(t, 'x', 'y')
0.61741639718977093

我们注意到,变量被指定的顺序并不重要。

correlation(t, 'y', 'x')
0.61741639718977093

suv表的列上调用correlation,可以使我们看到价格和效率之间的相关性,以及价格和加速度之间的相关性。

correlation(suv, 'mpg', 'msrp')
-0.6667143635709919
correlation(suv, 'acceleration', 'msrp')
0.48699799279959155

这些数值证实了我们的观察:

价格和效率之间存在负相关关系,而价格和加速度之间存在正相关关系。 价格和加速度之间的线性关系(相关性约为 0.5),比价格和效率之间的线性关系稍弱(相关性约为 -0.67)。 相关性是一个简单而强大的概念,但有时会被误用。 在使用r之前,重要的是要知道相关性能做和不能做什么。

相关不是因果

相关只衡量关联,并不意味着因果。 尽管学区内的孩子的体重与数学能力之间的相关性可能是正的,但这并不意味着做数学会使孩子更重,或者说增加体重会提高孩子的数学能力。 年龄是一个使人混淆的变量:平均来说,较大的孩子比较小的孩子更重,数学能力更好。

相关性度量线性关联

相关性只测量一种关联 - 线性关联。 具有较强非线性关联的变量可能具有非常低的相关性。 这里有一个变量的例子,它具有完美的二次关联y = x ^ 2,但是相关性等于 0。

new_x = np.arange(-4, 4.1, 0.5)
nonlinear = Table().with_columns(
        'x', new_x,
        'y', new_x**2
    )
nonlinear.scatter('x', 'y', s=30, color='r')

correlation(nonlinear, 'x', 'y')
0.0

相关性受到离群点影响

离群点可能对相关性有很大的影响。 下面是一个例子,其中通过增加一个离群点,r等于 1 的散点图变成r等于 0 的图。

line = Table().with_columns(
        'x', make_array(1, 2, 3, 4),
        'y', make_array(1, 2, 3, 4)
    )
line.scatter('x', 'y', s=30, color='r')

correlation(line, 'x', 'y')
1.0
outlier = Table().with_columns(
        'x', make_array(1, 2, 3, 4, 5),
        'y', make_array(1, 2, 3, 4, 0)
    )
outlier.scatter('x', 'y', s=30, color='r')

correlation(outlier, 'x', 'y')
0.0

生态相关性应谨慎解读

基于汇总数据的相关性可能会产生误导。 作为一个例子,这里是 2014 年 SAT 批判性阅读和数学成绩的数据。50 个州和华盛顿特区各有一个点。Participation Rate列包含参加考试的高中学生的百分比。 接下来的三列显示了每个州的测试每个部分的平均得分,最后一列是测试总得分的平均值。

sat2014 = Table.read_table('sat2014.csv').sort('State')
sat2014
StateParticipation RateCritical ReadingMathWritingCombined
Alabama6.75475385321617
Alaska54.25075034751485
Arizona36.45225255001547
Arkansas4.25735715541698
California60.34985104961504
Colorado14.35825865671735
Connecticut88.45075105081525
Delaware1004564594441359
District of Columbia1004404384311309
Florida72.24914854721448

(省略了 41 行)

数学得分与批判性阅读得分的散点图紧密聚集在一条直线上; 相关性接近 0.985。

sat2014.scatter('Critical Reading', 'Math')

correlation(sat2014, 'Critical Reading', 'Math')
0.98475584110674341

这是个非常高的相关性。但重要的是要注意,这并不能反映学生的数学和批判性阅读得分之间的关系强度。

数据由每个州的平均分数组成。但是各州不参加考试 - 而是学生。表中的数据通过将每个州的所有学生聚集为(这个州里面的两个变量的均值处的)单个点而创建。但并不是所有州的学生都会在这个位置,因为学生的表现各不相同。如果你为每个学生绘制一个点,而不是每个州一个点,那么在上图中的每个点周围都会有一圈云状的点。整体画面会更模糊。学生的数学和批判性阅读得分之间的相关性,将低于基于州均值计算的数值。

基于聚合和均值的相关性被称为生态相关性,并且经常用于报告。正如我们刚刚所看到的,他们必须谨慎解读。

严重还是开玩笑?

2012 年,在著名的《新英格兰医学杂志》(New England Journal of Medicine)上发表的一篇论文,研究了一组国家巧克力消费与的诺贝尔奖之间的关系。《科学美国人》(Scientific American)严肃地做出回应,而其他人更加轻松。 欢迎你自行决定!下面的图表应该让你有兴趣去看看。

回归直线

相关系数r并不只是测量散点图中的点聚集在一条直线上的程度。 它也有助于确定点聚集的直线。 在这一节中,我们将追溯高尔顿和皮尔逊发现这条直线的路线。

高尔顿的父母及其成年子女身高的数据显示出线性关系。 当我们基于双亲身高的子女身高的预测大致沿着直线时,就证实了线性。

galton = Table.read_table('galton.csv')

heights = Table().with_columns(
    'MidParent', galton.column('midparentHeight'),
    'Child', galton.column('childHeight')
    )
def predict_child(mpht):
    """Return a prediction of the height of a child 
    whose parents have a midparent height of mpht.
    
    The prediction is the average height of the children 
    whose midparent height is in the range mpht plus or minus 0.5 inches.
    """

    close_points = heights.where('MidParent', are.between(mpht-0.5, mpht + 0.5))
    return close_points.column('Child').mean()   
heights_with_predictions = heights.with_column(
    'Prediction', heights.apply(predict_child, 'MidParent')
    )
heights_with_predictions.scatter('MidParent')

标准单位下的度量

让我们看看,我们是否能找到一个方法来确定这条线。 首先,注意到线性关联不依赖于度量单位 - 我们也可以用标准单位来衡量这两个变量。

def standard_units(xyz):
    "Convert any array of numbers to standard units."
    return (xyz - np.mean(xyz))/np.std(xyz)  
heights_SU = Table().with_columns(
    'MidParent SU', standard_units(heights.column('MidParent')),
    'Child SU', standard_units(heights.column('Child'))
)
heights_SU
MidParent SUChild SU
3.454651.80416
3.454650.686005
3.454650.630097
3.454650.630097
2.472091.88802
2.472091.60848
2.47209-0.348285
2.47209-0.348285
1.583891.18917
1.583890.350559

(省略了 924 行)

在这个刻度上,我们可以像以前一样精确地计算我们的预测。 但是首先我们必须弄清楚,如何将“接近”的点的旧定义转换为新的刻度上的一个值。 我们曾经说过,如果双亲高度在 0.5 英寸之内,它们就是“接近”的。 由于标准单位以标准差为单位测量距离,所以我们必须计算出,0.5 英寸是多少个双亲身高的标准差。

双亲身高的标准差约为 1.8 英寸。 所以 0.5 英寸约为 0.28 个标准差。

sd_midparent = np.std(heights.column(0))
sd_midparent
1.8014050969207571
0.5/sd_midparent
0.27756111096536701

现在我们准备修改我们的预测函数,来预测标准单位。 所有改变的是,我们正在使用标准单位的值的表格,并定义如上所述的“接近”。

def predict_child_su(mpht_su):
    """Return a prediction of the height (in standard units) of a child 
    whose parents have a midparent height of mpht_su in standard units.
    """
    close = 0.5/sd_midparent
    close_points = heights_SU.where('MidParent SU', are.between(mpht_su-close, mpht_su + close))
    return close_points.column('Child SU').mean()   
heights_with_su_predictions = heights_SU.with_column(
    'Prediction SU', heights_SU.apply(predict_child_su, 'MidParent SU')
    )
heights_with_su_predictions.scatter('MidParent SU')

这个绘图看起来就像在原始刻度上绘图。 只改变了轴上的数字。 这证实了我们可以通过在标准单位下工作,来理解预测过程。

确定标准单位下的直线

高尔顿的散点图形状是个橄榄球 - 就是说,像橄榄球一样大致椭圆形。不是所有的散点图都是橄榄形的,甚至那些线性关联的也不都是。但在这一节中,我们假装我们是高尔顿,只能处理橄榄形的散点图。在下一节中,我们将把我们的分析推广到其他形状的绘图。

这里是一个橄榄形散点图,两个变量以标准单位测量。 45 度线显示为红色。

但是 45 度线不是经过垂直条形的中心的线。你可以看到在下图中,1.5 个标准单位的垂直线显示为黑色。蓝线附近的散点图上的点的高度都大致在 -2 到 3 的范围内。红线太高,无法命中中心。

所以 45 度线不是“均值图”。该线是下面显示的绿线。

两条线都经过原点(0,0)。绿线穿过垂直条形的中心(至少大概),比红色的 45 度线平坦。

45 度线的斜率为 1。所以绿色的“均值图”直线的斜率是正值但小于 1。

这可能是什么值呢?你猜对了 - 这是r

标准单位下的回归直线

绿色的“均值图”线被称为回归直线,我们将很快解释原因。 但首先,让我们模拟一些r值不同的橄榄形散点图,看看直线是如何变化的。 在每种情况中,绘制红色 45 度线作比较。

执行模拟的函数为regression_line,并以r为参数。

regression_line(0.95)

regression_line(0.6)

r接近于 1 时,散点图,45 度线和回归线都非常接近。 但是对于r较低值来说,回归线显然更平坦。

回归效应

就预测而言,这意味着,对于双亲身高为 1.5 个标准单位的家长来说,我们对女子身高的预测要稍低于 1.5 个标准单位。如果双亲高度是 2 个标准单位,我们对子女身高的预测,会比 2 个标准单位少一些。

换句话说,我们预测,子女会比父母更接近均值。

弗朗西斯·高尔顿爵士就不高兴了。他一直希望,特别高的父母会有特别高的子女。然而,数据是清楚的,高尔顿意识到,高个子父母通常拥有并不是特别高的子女。高尔顿沮丧地将这种现象称为“回归平庸”。

高尔顿还注意到,特别矮的父母通常拥有相对于他们这一代高一些的子女。一般来说,一个变量的平均值远远低于另一个变量的平均值。这被称为回归效应。

回归直线的方程

在回归中,我们使用一个变量(我们称x)的值来预测另一个变量的值(我们称之为y)。 当变量xy以标准单位测量时,基于x预测y的回归线斜率为r并通过原点。 因此,回归线的方程可写为:

在数据的原始单位下,就变成了:

原始单位的回归线的斜率和截距可以从上图中导出。

下面的三个函数计算相关性,斜率和截距。 它们都有三个参数:表的名称,包含x的列的标签以及包含y的列的标签。

def correlation(t, label_x, label_y):
    return np.mean(standard_units(t.column(label_x))*standard_units(t.column(label_y)))

def slope(t, label_x, label_y):
    r = correlation(t, label_x, label_y)
    return r*np.std(t.column(label_y))/np.std(t.column(label_x))

def intercept(t, label_x, label_y):
    return np.mean(t.column(label_y)) - slope(t, label_x, label_y)*np.mean(t.column(label_x))

回归直线和高尔顿的数据

双亲身高和子女身高之间的相关性是 0.32:

galton_r = correlation(heights, 'MidParent', 'Child')
galton_r
0.32094989606395924

我们也可以找到回归直线的方程,来基于双亲身高预测子女身高:

galton_slope = slope(heights, 'MidParent', 'Child')
galton_intercept = intercept(heights, 'MidParent', 'Child')
galton_slope, galton_intercept
(0.63736089696947895, 22.636240549589751)

回归直线的方程是:

这也成为回归方程。回归方程的主要用途是根据x预测y

例如,对于 70.48 英寸的双亲身高,回归直线预测,子女身高为 67.56 英寸。

galton_slope*70.48 + galton_intercept
67.557436567998622

我们最初的预测,通过计算双亲身高接近 70.48 的所有子女的平均身高来完成,这个预测非常接近:67.63 英寸,而回归线的预测是 67.55 英寸。

heights_with_predictions.where('MidParent', are.equal_to(70.48)).show(3)
MidParentChildPrediction
70.487467.6342
70.487067.6342
70.486867.6342

(省略了 5 行)

这里是高尔顿的表格的所有行,我们的原始预测,以及子女身高的回归预测。

heights_with_predictions = heights_with_predictions.with_column(
    'Regression Prediction', galton_slope*heights.column('MidParent') + galton_intercept
)
heights_with_predictions
MidParentChildPredictionRegression Prediction
75.4373.270.170.7124
75.4369.270.170.7124
75.436970.170.7124
75.436970.170.7124
73.6673.570.415869.5842
73.6672.570.415869.5842
73.6665.570.415869.5842
73.6665.570.415869.5842
72.067168.502568.5645
72.066868.502568.5645

(省略了 924 行)

heights_with_predictions.scatter('MidParent')

灰色圆点显示回归预测,全部在回归线上。 注意这条线与均值的金色图非常接近。 对于这些数据,回归线很好地逼近垂直条形的中心。

拟合值

所有的预测值都在直线上,被称为“拟合值”。 函数fit使用表名和xy的标签,并返回一个拟合值数组,散点图中每个点一个。

def fit(table, x, y):
    """Return the height of the regression line at each x value."""
    a = slope(table, x, y)
    b = intercept(table, x, y)
    return a * table.column(x) + b

下图比上图更轻易看到直线:

heights.with_column('Fitted', fit(heights, 'MidParent', 'Child')).scatter('MidParent')

另一个绘制直线的方式是在表方法scatter中,使用选项fit_line=True

heights.scatter('MidParent', fit_line=True)

斜率的测量单位

斜率是一个比值,值得花点时间来研究它的测量单位。 我们的例子来自熟悉的医院系统中产妇的数据集。 孕期体重与高度的散点图看起来像是一个橄榄球,已经在一场比赛中使用了很多次,但足够接近橄榄球,我们可以让我们的拟合直线穿过它来证明。 在后面的章节中,我们将看到如何使这种证明更正式。

baby = Table.read_table('baby.csv')
baby.scatter('Maternal Height', 'Maternal Pregnancy Weight', fit_line=True)

slope(baby, 'Maternal Height', 'Maternal Pregnancy Weight')
3.5728462592750558

回归线的斜率是 3.57 磅每英寸。 这意味着,对于身高相差 1 英寸的两名女性来说,我们对孕期体重的预测相差 3.57 磅。 对于身高相差 2 英寸的女性,我们预测的孕期体重相差2 * 3.57 ~= 7.14磅。

请注意,散点图中的连续垂直条形相距 1 英寸,因为高度已经舍入到最近的英寸。 另一种考虑斜率的方法是取两个相连的条形(相隔 1 英寸),相当于两组身高相差 1 英寸的女性。 3.57 磅每英寸的斜率意味着,较高组的平均孕期体重比较矮组多大约 3.57 磅。

示例

假设我们的目标是使用回归,基于巴塞特猎犬的体重来估计它的身高,所用的样本与回归模型看起来一致。 假设观察到的相关性r为 0.5,并且这两个变量的汇总统计量如下表所示:

averageSD
height14 inches2 inches
weight50 pounds5 pounds

为了计算回归线的方程,我们需要斜率和截距。

回归线的方程允许我们,根据给定重量(磅)计算估计高度(英寸):

线的斜率衡量随着重量的单位增长的估计高度的增长。 斜率是正值,重要的是要注意,这并不表示我们认为,如果体重增加巴塞特猎狗就会变得更高。 斜率反映了两组狗的平均身高的差异,这两组狗的体重相差 1 磅。 具体来说,考虑一组重量为w磅,以及另一组重量为w + 1磅的狗。 我们估计,第二组的均值高出 0.2 英寸。 对于样本中的所有w值都是如此。

一般来说,回归线的斜率可以解释为随着x单位增长的y平均增长。 请注意,如果斜率为负值,那么对于x的每单位增长,y的平均值会减少。

尾注

即使我们没有建立回归方程的数学基础,我们可以看到,当散点图是橄榄形的时候,它会给出相当好的预测。 这是一个令人惊讶的数学事实,无论散点图的形状如何,同一个方程给出所有直线中的“最好”的预测。 这是下一节的主题。

最小二乘法

我们已经回溯了高尔顿和皮尔森用于开发回归线方程的步骤,它穿过橄榄形的散点图。但不是所有的散点图都是橄榄形的,甚至不是线性的。每个散点图都有一个“最优”直线吗?如果是这样,我们仍然可以使用上一节中开发的斜率和截距公式,还是需要新的公式?

为了解决这些问题,我们需要一个“最优”的合理定义。回想一下,这条线的目的是预测或估计y的值,在给定x值的情况下。估计通常不是完美的。每个值都由于误差而偏离真正的值。“最优”直线的合理标准是,它在所有直线中总体误差尽可能最小。

在本节中,我们将精确确定这个标准,看看我们能否确定标准下的最优直线。

我们的第一个例子是小说《小女人》数据集,每章都有一行。目标是根据句子数来估计字符数(即字母,空格标点符号等等)。回想一下,我们在本课程的第一堂课中试图实现它。

little_women = Table.read_table('little_women.csv')
little_women = little_women.move_to_start('Periods')
little_women.show(3)
PeriodsCharacters
18921759
18822148
23120558

(省略了 44 行)

little_women.scatter('Periods', 'Characters')

为了探索数据,我们将需要使用上一节定义的函数correlationslopeinterceptfit

correlation(little_women, 'Periods', 'Characters')
0.92295768958548163

散点图明显接近线性,相关性大于 0.92。

估计中的误差

下图显示了我们在上一节中开发的散点图和直线。 我们还不知道这是否是所有直线中最优的。 我们首先必须准确表达“最优”的意思。

lw_with_predictions = little_women.with_column('Linear Prediction', fit(little_women, 'Periods', 'Characters'))
lw_with_predictions.scatter('Periods')

对应于散点图上的每个点,预测的误差是计算为实际值减去预测值。 它是点与直线之间的垂直距离,如果点在线之下,则为负值。

actual = lw_with_predictions.column('Characters')
predicted = lw_with_predictions.column('Linear Prediction')
errors = actual - predicted
lw_with_predictions.with_column('Error', errors)
PeriodsCharactersLinear PredictionError
1892175921183.6575.403
1882214821096.61051.38
2312055824836.7-4278.67
1952552621705.53820.54
2552339526924.1-3529.13
1401462216921.7-2299.68
1311443116138.9-1707.88
2142247623358-882.043
3373376734056.3-289.317
1851850820835.7-2327.69

(省略了 37 行)

我们可以使用slopeintercept来计算拟合直线的斜率和截距。 下图显示了该直线(浅蓝色)。 对应于四个点的误差以红色显示。 这四个点没什么特别的。 他们只是为了展示的清晰而被选中。 函数lw_errors以斜率和截距(按照该顺序)作为参数,并绘制该图形。

lw_reg_slope = slope(little_women, 'Periods', 'Characters')
lw_reg_intercept = intercept(little_women, 'Periods', 'Characters')
print('Slope of Regression Line:    ', np.round(lw_reg_slope), 'characters per period')
print('Intercept of Regression Line:', np.round(lw_reg_intercept), 'characters')
lw_errors(lw_reg_slope, lw_reg_intercept)
Slope of Regression Line:     87.0 characters per period
Intercept of Regression Line: 4745.0 characters

如果我们用不同的线来创建我们的估计,误差将会不同。 下面的图表显示了如果我们使用另一条线进行估算,误差会有多大。 第二张图显示了通过使用完全愚蠢的线获得了较大误差。

lw_errors(50, 10000)

lw_errors(-100, 50000)

均方根误差(RMSE)

我们现在需要的是误差大小的一个总体衡量。 你会认识到创建它的方法 - 这正是我们开发标准差的方式。

如果你使用任意直线来计算你的估计值,那么你的一些误差可能是正的,而其他的则是负的。 为了避免误差大小在测量时抵消,我们将采用误差平方的均值而不是误差的均值。

估计的均方误差大概是误差的平方有多大,但正如我们前面提到的,它的单位很难解释。 取平方根产生均方根误差(RMSE),与预测变量的单位相同,因此更容易理解。

使 RMSE 最小

到目前为止,我们的观察可以总结如下。

  • 要根据x估算y,可以使用任何你想要的直线。
  • 每个直线都有估计的均方根误差。
  • “更好”的直线有更小的误差。

有没有“最好”的直线? 也就是说,是否有一条线可以使所有行中的均方根误差最小?

为了回答这个问题,我们首先定义一个函数lw_rmse,通过《小女人》的散点图来计算任意直线的均方根误差。 函数将斜率和截距(按此顺序)作为参数。

def lw_rmse(slope, intercept):
    lw_errors(slope, intercept)
    x = little_women.column('Periods')
    y = little_women.column('Characters')
    fitted = slope * x + intercept
    mse = np.mean((y - fitted) ** 2)
    print("Root mean squared error:", mse ** 0.5)
lw_rmse(50, 10000)
Root mean squared error: 4322.16783177

lw_rmse(-100, 50000)
Root mean squared error: 16710.1198374

正如预期的那样,不好的直线 RMSE 很大。 但是如果我们选择接近于回归线的斜率和截距,则 RMSE 要小得多。

lw_rmse(90, 4000)
Root mean squared error: 2715.53910638

这是对应于回归线的均方根误差。 通过显着的数学事实,没有其他线路能击败这一条。

回归线是所有直线之间的唯一直线,使估计的均方误差最小。

lw_rmse(lw_reg_slope, lw_reg_intercept)
Root mean squared error: 2701.69078531

这个声明的证明需要超出本课程范围的抽象数学。 另一方面,我们有一个强大的工具 -- Python,它可以轻松执行大量的数值计算。 所以我们可以使用 Python 来确认回归线最小化的均方误差。

数值优化

首先注意,使均方根误差最小的直线,也是使平方误差最小的直线。 平方根对最小值没有任何影响。 所以我们会为自己节省一个计算步骤,并将平均方差 MSE 减到最小。

我们试图根据《小女人》的句子数(x)来预测字符数量(y)。 如果我们使用 直线,它将有一个 MSE,它取决于斜率a和截距b。 函数lw_mse以斜率和截距为参数,并返回相应的 MSE。

def lw_mse(any_slope, any_intercept):
    x = little_women.column('Periods')
    y = little_women.column('Characters')
    fitted = any_slope*x + any_intercept
    return np.mean((y - fitted) ** 2)

让我们确认一下,lw_mse得到回归线的 RMSE 的正确答案。 请记住,lw_mse返回均方误差,所以我们必须取平方根来得到 RMSE。

lw_mse(lw_reg_slope, lw_reg_intercept)**0.5
2701.690785311856

它和我们之前使用lw_rmse得到的值相同。

lw_rmse(lw_reg_slope, lw_reg_intercept)
Root mean squared error: 2701.69078531

你可以确认对于其他的斜率和截距,lw_mse也返回正确的值。 例如,这里是我们之前尝试的,非常不好的直线的 RMSE。

lw_mse(-100, 50000)**0.5
16710.119837353752

这里是这条直线的 RMSE,它接近回归线。

lw_mse(90, 4000)**0.5
2715.5391063834586

如果我们尝试不同的值,我们可以通过反复试验找到一个误差较低的斜率和截距,但这需要一段时间。 幸运的是,有一个 Python 函数为我们做了所有的试错。

minimize函数可用于寻找函数的参数,函数在这里返回其最小值。 Python 使用类似的试错法,遵循使输出值递减的变化量。

minimize的参数是一个函数,它本身接受数值参数并返回一个数值。 例如,函数lw_mse以数值斜率和截距作为参数,并返回相应的 MSE。

调用minimize(lw_mse)返回一个数组,由斜率和截距组成,它们使 MSE 最小。 这些最小值是通过智能试错得出的极好的近似值,而不是基于公式的精确值。

best = minimize(lw_mse)
best
array([   86.97784117,  4744.78484535])

这些值与我们之前使用slopeintercept函数计算的值相同。 由于最小化的不精确性,我们看到较小的偏差,但是这些值本质上是相同的。

print("slope from formula:        ", lw_reg_slope)
print("slope from minimize:       ", best.item(0))
print("intercept from formula:    ", lw_reg_intercept)
print("intercept from minimize:   ", best.item(1))
slope from formula:         86.9778412583
slope from minimize:        86.97784116615884
intercept from formula:     4744.78479657
intercept from minimize:    4744.784845352655

最小二乘直线

因此我们发现,不仅回归线具有最小的均方误差,而且均方误差的最小化也给出了回归线。 回归线是最小化均方误差的唯一直线。

这就是回归线有时被称为“最小二乘直线”的原因。

最小二乘回归

在前面的章节中,我们开发了回归直线的斜率和截距方程,它穿过一个橄榄形的散点图。 事实证明,无论散点图的形状如何,最小二乘直线的斜率和截距都与我们开发的公式相同。

我们在《小女人》的例子中看到了它,但是让我们以散点图显然不是橄榄形的例子来证实它。 对于这些数据,我们再次受惠于佛罗里达大学 Larry Winner 教授的丰富数据档案。 《国际运动科学杂志》(International Journal of Exercise Science)2013 年的一项研究,研究了大学生铅球运动员,并考察了力量与铅球距离的关系。 总体由 28 名女大学生运动员组成。 运动员在赛季前的“1RM power clean”中举起的最大值(公斤)是衡量力量的指标。 距离(米)是运动员个人最佳成绩。

shotput = Table.read_table('shotput.csv')
shotput
Weight LiftedShot Put Distance
37.56.4
51.510.2
61.312.4
61.313
63.613.2
66.113
7012.7
92.713.9
90.515.5
90.515.8

(省略了 18 行)

shotput.scatter('Weight Lifted')

这不是橄榄形的散点图。 事实上,它似乎有一点非线性成分。 但是,如果我们坚持用一条直线来做出预测,那么所有直线之中仍然有一条最好的直线。

我们为回归线的斜率和截距建立公式,它来源于橄榄形的散点图,并给出了下列值:

slope(shotput, 'Weight Lifted', 'Shot Put Distance')
0.098343821597819972
intercept(shotput, 'Weight Lifted', 'Shot Put Distance')
5.9596290983739522

即使散点图不是橄榄形,使用这些公式还有意义吗? 我们可以通过求出使 MSE 最小的斜率和截距来回答这个问题。

我们将定义函数shotput_linear_mse,以斜体和截距作为参数并返回相应的 MSE。 然后将minimize应用于shotput_linear_mse将返回最优斜率和截距。

def shotput_linear_mse(any_slope, any_intercept):
    x = shotput.column('Weight Lifted')
    y = shotput.column('Shot Put Distance')
    fitted = any_slope*x + any_intercept
    return np.mean((y - fitted) ** 2)
minimize(shotput_linear_mse)
array([ 0.09834382,  5.95962911])

这些值与我们使用我们的公式得到的值相同。 总结:

无论散点图的形状如何,都有一条独特的线,可以使估计的均方误差最小。 它被称为回归线,其斜率和截距由下式给出:

译者注:也就是cov(x, y)/var(x)

fitted = fit(shotput, 'Weight Lifted', 'Shot Put Distance')
shotput.with_column('Best Straight Line', fitted).scatter('Weight Lifted')

非线性回归

上面的图表强化了我们之前的观察,即散点图有点弯曲。 因此,最好拟合曲线而不是直线。 研究假设举起的重量与铅球距离之间是二次关系。 所以让我们使用二次函数来预测,看看我们能否找到最好的曲线。

我们必须找到所有二次函数中最好的二次函数,而不是所有直线中最好的直线。 最小二乘法允许我们这样做。

这种最小化的数学是复杂的,不容易仅仅通过检查散点图来发现。 但是数值最小化和线性预测一样简单! 再次通过使用最小化我们可以得到最好的二次预测。 让我们看看这是如何工作的。

回想一下,二次函数的形式:

f(x) = ax^2 + bx + c

abc是常数。

为了基于举起的重量找到最好的二次函数来预测距离,使用最小二乘法,我们首先编写一个函数,以三个常量为自变量的,用上面的二次函数计算拟合值,然后返回均方误差。

该函数被称为shotput_quadratic_mse。 请注意,定义与lw_mse的定义类似,不同的是拟合值基于二次函数而不是线性。

def shotput_quadratic_mse(a, b, c):
    x = shotput.column('Weight Lifted')
    y = shotput.column('Shot Put Distance')
    fitted = a*(x**2) + b*x + c
    return np.mean((y - fitted) ** 2)

我们现在可以像之前那样使用minimize,并找到使 MSE 最小的常数。

best = minimize(shotput_quadratic_mse)
best
array([ -1.04004838e-03,   2.82708045e-01,  -1.53182115e+00])

我们预测,一个举起x公斤的运动员的铅球距离大概是-0.00104x^2 + 0.2827x - 1.5318米。 例如,如果运动员可以举起 100 公斤,预测的距离是 16.33 米。 在散点图上,在 100 公斤左右的垂直条形的中心附近。

(-0.00104)*(100**2) + 0.2827*100 - 1.5318
16.3382

以下是所有Weight Lifted的预测。 你可以看到他们穿过散点图的中心,大致上接近。

x = shotput.column(0)
shotput_fit = best.item(0)*(x**2) + best.item(1)*x + best.item(2)
shotput.with_column('Best Quadratic Curve', shotput_fit).scatter(0)

视觉诊断

假设数据科学家已经决定使用线性回归,基于预测变量估计响应变量的值。 为了了解这种估计方法的效果如何,数据科学家必须知道估计值距离实际值多远。 这些差异被称为残差。

残差就是剩下的东西 - 估计之后的剩余。

残差是回归线和点的垂直距离。 散点图中的每个点都有残差。 残差是y的观测值与y的拟合值之间的差值,所以对于点(x, y)

residual函数计算残差。 该计算假设我们已经定义的所有相关函数:standard_unitscorrelationslopeinterceptfit

def residual(table, x, y):
    return table.column(y) - fit(table, x, y)

继续使用高尔顿的数据的例子,基于双亲身高(预测变量)来估计成年子女身高(响应变量),让我们计算出拟合值和残差。

heights = heights.with_columns(
        'Fitted Value', fit(heights, 'MidParent', 'Child'),
        'Residual', residual(heights, 'MidParent', 'Child')
    )
heights
MidParentChildFitted ValueResidual
75.4373.270.71242.48763
75.4369.270.7124-1.51237
75.436970.7124-1.71237
75.436970.7124-1.71237
73.6673.569.58423.91576
73.6672.569.58422.91576
73.6665.569.5842-4.08424
73.6665.569.5842-4.08424
72.067168.56452.43553
72.066868.5645-0.564467

(省略了 924 行)

如果要处理的变量太多,以可视化开始总是很有帮助的。 函数scatter_fit绘制数据的散点图,以及回归线。

def scatter_fit(table, x, y):
    table.scatter(x, y, s=15)
    plots.plot(table.column(x), fit(table, x, y), lw=4, color='gold')
    plots.xlabel(x)
    plots.ylabel(y)
scatter_fit(heights, 'MidParent', 'Child')

通过绘制残差和预测变量来绘制残差图。函数residual_plot就是这样做的。

def residual_plot(table, x, y):
    x_array = table.column(x)
    t = Table().with_columns(
            x, x_array,
            'residuals', residual(table, x, y)
        )
    t.scatter(x, 'residuals', color='r')
    xlims = make_array(min(x_array), max(x_array))
    plots.plot(xlims, make_array(0, 0), color='darkblue', lw=4)
    plots.title('Residual Plot')
residual_plot(heights, 'MidParent', 'Child')

双亲身高在横轴上,就像原始散点图中一样。 但是现在纵轴显示了残差。 请注意,该图看上去以y=0的横线为中心(以深蓝色显示)。 还要注意,绘图没有显示上升或下降的趋势。 我们稍后会观察到所有的回归都是如此。

回归诊断

残差图有助于我们直观评估线性回归分析的质量。 这种评估被称为诊断。 函数regression_diagnostic_plots绘制原始散点图以及残差图,以便于比较。

def regression_diagnostic_plots(table, x, y):
    scatter_fit(table, x, y)
    residual_plot(table, x, y)
regression_diagnostic_plots(heights, 'MidParent', 'Child')

这个残差图表明,线性回归是合理的估计方法。 注意残差关于y=0的横线上下对称分布,相当于原始散点图大致上下对称。 还要注意,绘图的垂直延伸,在子女身高最常见的值上相当均匀。 换句话说,除了一些离群点之外,绘图并不是一些地方窄。另一些地方宽。

换句话说,在预测变量的观察范围内,回归的准确性似乎是相同的。

良好回归的残差图不显示任何规律。 在预测变量的范围内,残差在y=0的直线处上下相同。

检测非线性

绘制数据的散点图,通常表明了两个变量之间的关系是否是非线性的。 然而,通常情况下,残差图中比原始散点图中更容易发现非线性。 这通常是因为这两个图的规模:残差图允许我们放大错误,从而更容易找出规律。

我们的数据是海牛的年龄和长度的数据集,这是一种海洋哺乳动物(维基共享资源图)。 数据在一个名为dugong的表中。 年龄以年为单位,长度以米为单位。 因为海牛通常不跟踪他们的生日,年龄是根据他们的牙齿状况等变量来估计的。

dugong = Table.read_table('http://www.statsci.org/data/oz/dugongs.txt')
dugong = dugong.move_to_start('Length')
dugong
LengthAge
1.81
1.851.5
1.871.5
1.771.5
2.022.5
2.274
2.155
2.265
2.357
2.478

(省略了 17 行)

如果我们可以衡量海牛的长度,对于它的年龄我们可以说什么呢? 让我们来看看我们的数据说了什么。 这是一个长度(预测变量)和年龄(响应变量)的回归。 这两个变量之间的相关性相当大,为 0.83。

correlation(dugong, 'Length', 'Age')
0.82964745549057139

尽管相关性仍然很高,绘图显示出曲线规律,在残差图中更加明显。

regression_diagnostic_plots(dugong, 'Length', 'Age')

虽然你可以发现原始散点图中的非线性,但在残差图中更明显。

在长度的较低一端,残差几乎都是正的;然后他们几乎都是负的;然后在较高一端,残差再次为正。 换句话说,回归估计值过高,然后过低,然后过高。 这意味着使用曲线而不是直线来估计年龄会更好。

当残差图显示了规律时,变量之间可能存在非线性关系。

检测异方差

异方差这个词,那些准备拼写游戏的人肯定会感兴趣。 对于数据科学家来说,其兴趣在于它的意义,即“不均匀延伸”。

回想一下hybrid表,包含美国混合动力汽车的数据。这是燃油效率对加速度的回归。这个关联是负面的:加速度高的汽车往往效率较低。

regression_diagnostic_plots(hybrid, 'acceleration', 'mpg')

注意残差图在加速度的较低一端变得发散。 换句话说,对于较低的加速度,误差的大小的变化比较高值更大。 残差图中比原始的散点图中更容易注意到不均匀的变化。

如果残差图显示y=0的横线处的不均匀变化,则在预测变量的范围内,回归的估计不是同等准确的。

数值诊断

除了可视化之外,我们还可以使用残差的数值属性来评估回归的质量。 我们不会在数学上证明这些属性。 相反,我们将通过计算来观察它们,看看它们告诉我们回归的什么东西。

下面列出的所有事实都适用于散点图的所有形状,无论它们是否是线性的。

残差图不展示形状

对于每一个线性回归,无论是好还是坏,残差图都不展示任何趋势。 总的来说,它是平坦的。 换句话说,残差和预测变量是不相关的。

你可以在上面所有的残差图中看到它。 我们还可以计算每种情况下,预测变量和残差之间的相关性。

correlation(heights, 'MidParent', 'Residual')
-2.7196898076470642e-16

这看起来不是零,但它是个很小的数字,除了由于计算的舍入误差之外,它就是零。 在这里也一样,取小数点后 10 位。 减号是因为上面的舍入。

round(correlation(heights, 'MidParent', 'Residual'), 10)
-0.0
dugong = dugong.with_columns(
       'Fitted Value', fit(dugong, 'Length', 'Age'),
       'Residual', residual(dugong, 'Length', 'Age')
)
round(correlation(dugong, 'Length', 'Residual'), 10)
0.0

残差的均值

不管散点图的形状如何,剩余的均值都是 0。

这类似于这样一个事实,如果你选取任何数值列表并计算距离均值的偏差的列表,则偏差的均值为 0。

在上面的所有残差图中,你看到y=0的横线穿过图的中心。 这是这个事实的可视化。

作为一个数值示例,这里是高尔顿数据集中,基于双亲高度的子女高度的回归的残差均值。

round(np.mean(heights.column('Residual')), 10)
0.0

海牛长度和年龄的回归的残差均值也是一样。 残差均值为 0,除了舍入误差。

round(np.mean(dugong.column('Residual')), 10)
0.0

残差的标准差

无论散点图的形状如何,残差的标准差是响应变量的标准差的一个比例。 比例是

我们将很快看到,它如何衡量回归估计的准确性。 但首先,让我们通过例子来确认。

在子女身高和双亲身高的案例中,残差的标准差约为 3.39 英寸。

np.std(heights.column('Residual'))
3.3880799163953426

这和响应变量的标准差乘sqrt(1 - r^2)相同。

r = correlation(heights, 'MidParent', 'Child')
np.sqrt(1 - r**2) * np.std(heights.column('Child'))
3.3880799163953421

混合动力汽车的加速和里程的回归也是如此。 相关性r是负数(约 -0.5),但r^2是正数,所以sqrt(1 - r^2)是一个分数。

r = correlation(hybrid, 'acceleration', 'mpg')
r
-0.5060703843771186
hybrid = hybrid.with_columns(
     'fitted mpg', fit(hybrid, 'acceleration', 'mpg'),
     'residual', residual(hybrid, 'acceleration', 'mpg')
)
np.std(hybrid.column('residual')), np.sqrt(1 - r**2)*np.std(hybrid.column('mpg'))
(9.4327368334302903, 9.4327368334302903)

现在让我们看看,残差的标准差是如何衡量回归的好坏。请记住,残差的均值为 0。因此,残差的标准差越小,则残差越接近于 0。换句话说,如果残差的标准差小,那么回归中的总体误差就小。

极端情况是r = 1r = -1。在这两种情况下,sqrt(1 - r^2) = 0。因此,残差的均值为 0,标准差为 0,因此残差都等于 0。回归线确实是完美的估计。我们在本章的前面看到,如果r = ± 1,散点图是一条完美的直线,与回归线相同,所以回归估计中确实没有错误。

但通常r不是极端的。如果r既不是±1也不是 0,那么sqrt(1 - r^2)是一个适当的分数,并且回归估计的误差大小,整体上大致在 0 和y的标准差之间。

最糟糕的情况是r = 0。那么sqrt(1 - r^2) = 1,残差的标准差等于y的标准差。这与观察结果一致,如果r = 0那么回归线就是y的均值上的一条横线。在这种情况下,回归的均方根误差是距离y的平均值的偏差的均方根,这是y的标准差。实际上,如果r = 0,那么这两个变量之间就没有线性关联,所以使用线性回归没有任何好处。

另一种解释r的方式

我们可以重写上面的结果,不管散点图的形状如何:

互补的结果是,无论散点图的形状如何,拟合值的标准差是观察值y的标准差的一个比例。比例是|r|

要查看比例在哪里出现,请注意拟合值全部位于回归线上,而y的观测值是散点图中所有点的高度,并且更加可变。

scatter_fit(heights, 'MidParent', 'Child')

拟合值的范围在 64 到 71 之间,而所有子女的身高则变化很大,大约在 55 到 80 之间。

为了在数值上验证结果,我们只需要计算双方的一致性。

correlation(heights, 'MidParent', 'Child')
0.32094989606395924

这里是出生体重的拟合值的标准差与观察值的标准差的比值:

np.std(heights.column('Fitted Value'))/np.std(heights.column('Child'))
0.32094989606395957

这个比例等于r,证实了我们的结果。

绝对值出现在哪里? 首先要注意的是,标准差不能是负数,标准差的比值也不行。 那么当r是负数时会发生什么呢? 燃油效率和加速度的例子将向我们展示。

correlation(hybrid, 'acceleration', 'mpg')
-0.5060703843771186
np.std(hybrid.column('fitted mpg'))/np.std(hybrid.column('mpg'))
0.5060703843771186

两个标准差的比值就是|r|

解释这个结果的更标准的方法是,回想一下:

因此,对结果的两边取平方: