把下列代码放到你的 .onInit 函数:
System::Call 'kernel32::CreateMutexA(i 0, i 0, t "myMutex") i .r1 ?e' Pop $R0 StrCmp $R0 0 +3 MessageBox MB_OK|MB_ICONEXCLAMATION "安装程序已经在运行。" Abort
myMutex 应该替换为你自己的唯一标识值。