前端 - 这种医学上使用的图表是什么插件绘制的呢？

Question

像这种医学上经常用的图表是由什么插件制作的？

从f12中看能查到这是svg+canvas渲染出来的 应该是某个图表插件渲染的。但是不清楚是什么插件有大佬知道的么？

Answer 1

你提供的图像似乎是一个基因表达或序列比对相关的可视化结果，可能来自某种生物信息学工具。常见的用于生成类似图表的插件或软件工具包括以下几种：

1. Integrative Genomics Viewer (IGV)

• 功能：IGV 是一种流行的用于可视化基因组数据的工具，可以处理大规模基因组数据集，并显示基因表达、变异、序列比对等信息。
• 插件/扩展：IGV 支持多种文件格式，可以加载不同类型的生物数据，并且可以进行热图、比对图等各种视图的展示。

2. Seurat

• 功能：Seurat 是一个用于单细胞 RNA 测序数据分析的 R 语言包，提供多种数据可视化功能，包括热图、基因表达图等。
• 插件：它拥有丰富的可视化功能和插件，可以展示单细胞数据的多样性和基因表达的复杂性。

3. GSEA (Gene Set Enrichment Analysis)

• 功能：GSEA 是一种基因集富集分析工具，广泛应用于理解基因表达数据。它可以生成热图、点图等，来展示基因集在不同条件下的表达差异。
• 插件/扩展：GSEA 提供丰富的可视化选项，可以与其他工具（如 Cytoscape）联动使用，增强数据可视化效果。

4. Clustergrammer

• 功能：Clustergrammer 是一个用于交互式热图的在线工具，可以处理和可视化大型基因表达矩阵数据。
• 插件：该工具可以直接从数据框中生成可视化热图，并支持用户交互，如缩放和聚类分析。

5. R Studio + ComplexHeatmap

• 功能：R Studio 中的 ComplexHeatmap 包用于生成复杂的热图，适用于多种生物信息学数据分析，如基因表达分析。
• 插件/扩展：支持丰富的注释和聚类选项，可以处理大量基因组数据。

6. Cytoscape

• 功能：Cytoscape 是一个用于网络分析和可视化的开源软件。它适用于分析大规模数据集，尤其是基因组、蛋白质相互作用网络等。
• 插件：Cytoscape 拥有多个插件用于不同类型的数据可视化，包括热图、网络图等。

7. Python + Matplotlib/Seaborn

• 功能：Python 中的 Matplotlib 和 Seaborn 库可以生成各种生物信息学相关的图表，包括热图、散点图、基因表达图等。
• 插件：通过自定义代码，可以生成高度定制化的图表来展示基因表达数据。