在R中的时间序列图中添加移动平均图

Question

我在ggplot2包中有一个时间序列的图，我已经执行了移动平均，我想把移动平均的结果添加到时间序列的图中。

数据集样本(p31):

ambtemp DT
-1.14 2007-09-29 00:01:57
-1.12 2007-09-29 00:03:57
-1.33 2007-09-29 00:05:57
-1.44 2007-09-29 00:07:57
-1.54 2007-09-29 00:09:57
-1.29 2007-09-29 00:09:57
-1.29 2007-09-29 00:11:57

  Require(ggplot2)
  library(scales)
  p29$dt=strptime(p31$dt, "%Y-%m-%d %H:%M:%S")
  ggplot(p29, aes(dt, ambtemp)) + geom_line() +
     scale_x_datetime(breaks = date_breaks("2 hour"),labels=date_format("%H:%M")) + xlab("Time 00.00 ~ 24:00 (2007-09-29)") + ylab("Tempreture")+
     opts(title = ("Node 29"))

挑战在于，时间序列数据OV=btain来自数据集，其中包括时间戳和温度，而移动平均数据只包括平均列而不包括时间戳，拟合这两个数据可能会导致不一致。

Answer 1

一个解决方案是使用libraryZoo中的rollmean()函数来计算移动平均值。

在你的问题(p31和p29)中有一些数据帧名称的混淆，所以我将使用p29。

p29$dt=strptime(p29$dt, "%Y-%m-%d %H:%M:%S")

library(zoo)
#Make zoo object of data
temp.zoo<-zoo(p29$ambtemp,p29$dt)

#Calculate moving average with window 3 and make first and last value as NA (to ensure identical length of vectors)
m.av<-rollmean(temp.zoo, 3,fill = list(NA, NULL, NA))

#Add calculated moving averages to existing data frame
p29$amb.av=coredata(m.av)

#Add additional line for moving average in red
ggplot(p29, aes(dt, ambtemp)) + geom_line() + 
  geom_line(aes(dt,amb.av),color="red") + 
  scale_x_datetime(breaks = date_breaks("5 min"),labels=date_format("%H:%M")) +
  xlab("Time 00.00 ~ 24:00 (2007-09-29)") + ylab("Tempreture")+
  ggtitle("Node 29")

如果线条颜色应该出现在图例中，那么必须修改ggplot()中的aes()和geom_line()并添加scale_colour_manual()。

  ggplot(p29, aes(dt)) + geom_line(aes(y=ambtemp,colour="real")) +
   geom_line(aes(y=amb.av,colour="moving"))+
   scale_x_datetime(breaks = date_breaks("5 min"),labels=date_format("%H:%M")) + 
   xlab("Time 00.00 ~ 24:00 (2007-09-29)") + ylab("Tempreture")+
   scale_colour_manual("Lines", values=c("real"="black", "moving"="red")) +    
   ggtitle("Node 29")