升级R到3.6-无法加载utils包

Question

我正在尝试在一个相当旧的ubuntu xenial版本上将R从3.4.4升级到3.6.0。

我遵循了这些指示：这里

以下是我采取的步骤：

1. sudo apt-get删除r-base-dev
2. echo'debhttps://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntutruy-cran35/'|sudo ted-a /etc/apt/sources.list
3. sudo apt-get更新
4. sudo apt-get安装r-base-dev

我的R版本更新到了3.6，但是，每当我在控制台中启动R时，都会收到以下消息:

Error: package or namespace load failed for ‘utils’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'utils', details:
  call: file(con, "r")
  error: cannot open the connection
Error: package or namespace load failed for ‘stats’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'utils', details:
  call: file(con, "r")
  error: cannot open the connection
During startup - Warning messages:
1: In file(con, "r") :
  cannot open file '/etc/os-release': Permission denied
2: package ‘utils’ in options("defaultPackages") was not found
3: In file(con, "r") :
  cannot open file '/etc/os-release': Permission denied
4: package ‘stats’ in options("defaultPackages") was not found

这是 /etc/os 版本的输出。我做了chmod到666，但没有任何变化。

NAME="Ubuntu"
VERSION="14.04.5 LTS, Trusty Tahr"
ID=ubuntu
ID_LIKE=debian
PRETTY_NAME="Ubuntu 14.04.5 LTS"
VERSION_ID="14.04"
HOME_URL="http://www.ubuntu.com/"
SUPPORT_URL="http://help.ubuntu.com/"
BUG_REPORT_URL="http://bugs.launchpad.net/ubuntu/"

这是我的libPaths的输出。

> .libPaths()
[1] "/home/myuser/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6"
[2] "/usr/local/lib/R/site-library"
[3] "/usr/lib/R/site-library"
[4] "/usr/lib/R/library"

我不能在r中安装任何软件包。任何帮助将不胜感激。

仅供参考-机器上安装了一个rstudio服务器，我根本没有碰过它。

Answer 1

好的，所以我做了以下操作：

1. 卸载以前的版本 - sudo apt-get remove r-base-dev
2. 从源代码下载 - wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.6.0.tar.gz
3. 请按照此处的说明进行操作
4. 设置路径后，我启动了R，但它仍然不起作用，但是我意识到它正在查看/usr/bin/R，由于某种原因，它可能不是正确的二进制文件。
5. 我删除了这个文件并创建了一个指向全新安装的符号链接 - sudo ln -s /opt/R/3.6.0/bin/R /usr/bin/R
6. 然后它像一个魅力一样工作。

仅供参考-在前面的步骤中，我已经停止了rStudio-server，以防它没有锁定任何文件。之后我重新启动了它，一切都很好。