如何获取值高于阈值列索引约束的行的计数？
我有以下R数据框架:
S.A1 S.A2 S.A3 S.B1 S.B2 S.B3
Loc1 0.3809 0.4444 0.5000 0.0011 0.0110 0.0003
Loc2 0.1762 0.2500 0.3333 0.5000 0.3250 0.2333
Loc3 0.2147 0.3500 0.2500 0.1428 0.2142 0.3000
Loc4 0.2382 0.4010 0.2222 0.3000 0.3095 0.3667
Loc5 0.0001 0.0120 0.0035 0.3333 0.4523 0.3333
Loc6 0.0095 0.0400 0.0490 0.1000 0.2321 0.1000
…还有更多的行！
我想得到我有值的行数。
例如：
- 多少行显示值
列类型S.A和S.B相互排斥，因此永远不会选择Loc2、Loc3和Loc4，因为这些都显示值
我减少了列的数量，因此可以为进一步的选择手动预定义列索引(或名称),但是，我不知道如何处理来选择显示超过某个阈值的值的行，同时还对可能出现这些值的列添加约束。
欢迎任何建议！
干杯：）
共有3个答案
非常感谢亚当和MKR。
我应该提到，我不想选择同时显示S.A和S.B列的列
例如，使用< code>dplyr:
df %>% select(S.A1,S.A2, S.A3, S.B1, S.B2, S.B3) %>% filter(S.A1 >= 0.05 & S.A2 >= 0.05 & S.A3 >= 0.05 & S.B1 < 0.05 & S.B2 < 0.05 & S.B3 < 0.05) %>% nrow()
df %>% select(S.A1,S.A2, S.A3, S.B1, S.B2, S.B3) %>% filter(S.B1 >= 0.05 & S.B2 >= 0.05 & S.B3 >= 0.05 & S.A1 < 0.05 & S.A2 < 0.05 & S.A3 < 0.05) %>% nrow()
我只需要添加额外的条件，其中S.A应该是全部
非常感谢！
一个选项是对选定列使用＜code＞dplyr：：filter_at＜/code＞作为：
library(tidyverse)
df %>% rownames_to_column() %>%
filter_at(vars(starts_with("S.A")), any_vars(. >= 0.50))
# rowname S.A1 S.A2 S.A3 S.B1 S.B2 S.B3
# 1 Loc1 0.3809 0.4444 0.5 0.0011 0.011 3e-04
df %>% rownames_to_column() %>%
filter_at(vars(starts_with("S.B")), any_vars(. >= 0.050))
# rowname S.A1 S.A2 S.A3 S.B1 S.B2 S.B3
# 1 Loc2 0.1762 0.250 0.3333 0.5000 0.3250 0.2333
# 2 Loc3 0.2147 0.350 0.2500 0.1428 0.2142 0.3000
# 3 Loc4 0.2382 0.401 0.2222 0.3000 0.3095 0.3667
# 4 Loc5 0.0001 0.012 0.0035 0.3333 0.4523 0.3333
# 5 Loc6 0.0095 0.040 0.0490 0.1000 0.2321 0.1000
注：如果OP的目的是检查所有选定列上的条件，则once可以将上述代码中的all_vars替换为any_var。
数据：
df <- read.table(text =
"S.A1 S.A2 S.A3 S.B1 S.B2 S.B3
Loc1 0.3809 0.4444 0.5000 0.0011 0.0110 0.0003
Loc2 0.1762 0.2500 0.3333 0.5000 0.3250 0.2333
Loc3 0.2147 0.3500 0.2500 0.1428 0.2142 0.3000
Loc4 0.2382 0.4010 0.2222 0.3000 0.3095 0.3667
Loc5 0.0001 0.0120 0.0035 0.3333 0.4523 0.3333
Loc6 0.0095 0.0400 0.0490 0.1000 0.2321 0.1000",
header = TRUE, stringsAsFactors = FALSE)
不知道你想要什么，但我想你想要这个:
library(dplyr)
df = data.frame(S.A1 = runif(6),
S.A2 = runif(6),
S.A3 = runif(6),
S.B1 = runif(6),
S.B2 = runif(6),
S.B3 = runif(6))
因为你没有提供一个可重复的例子，我冒昧地制作了df。它看起来像：
S.A1 S.A2 S.A3 S.B1 S.B2 S.B3
1 0.7050447 0.3425170 0.24222797 0.89027284 0.6516980 0.12141078
2 0.5982959 0.9922373 0.87056458 0.43965606 0.6688127 0.05517046
3 0.9416712 0.5065097 0.01904794 0.08972336 0.6339239 0.63476302
4 0.8578870 0.7158088 0.28133235 0.02191547 0.6814373 0.50473500
5 0.5962874 0.8617246 0.04189701 0.59269613 0.6201409 0.32715440
6 0.1642811 0.2287726 0.76770094 0.22238414 0.9873463 0.06580177
然后我们选择有问题的列，并说所有这些列都需要大于或等于某个截止值，在本例中为0.05，并获得行数。
df %>% select(S.A1,S.A2, S.A3) %>% filter(S.A1 >= .05 & S.A2 >= 0.05 & S.A3 >= 0.05) %>% nrow()
df %>% select(S.B1,S.B2, S.B3) %>% filter(S.B1 >= .05 & S.B2 >= 0.05 & S.B3 >= 0.05) %>% nrow()
这将产生：＜代码＞4
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