R编程语言的Python接口

Question

我对R很陌生，并且对python很熟悉。我不太喜欢编写R代码。我正在寻找R的python接口，这使我能够以 pythonic方式 使用R包。

我已经完成了谷歌研究，发现有几个软件包可以做到这一点：

• Rpy2
• PypeR
• pyRserve

但是不确定哪个更好？哪个贡献者更多，使用更积极？

请注意，我的主要要求是 访问R包的pythonic方法 。

Answer 1

正如@lgautier所指出的那样，[在这个问题上](http://codingdict.com/questions/163863已经有了另一个答案。我在这里留下我的答案，因为它增加了将R作为新手的经验，首先了解Python。

我同时使用Python和R，并同意您作为R的新手的需要。

由于您得到的任何答案都是主观的，因此，根据我的经验，我总结了几点：

• 我使用rpy2作为我的界面，发现它是“ Pythonic”的，稳定的，可预测的并且足以满足我的需求。我没有使用其他软件包，因此这不是对它们的评论，而是对rpy2本身的优点的评论。
• 但是不要指望在不学习两者的情况下，会有在Python中使用R的简便方法。我发现在两种语言之间都添加接口可以简化编码，但同时又会给缺少一种语言的人带来调试的噩梦。

我的建议：

1. 对于大多数应用程序，Python提供了一些程序包，这些程序包使您可以执行R中想要执行的大多数操作，从数据整理到绘图。查看SciPy，NumPy，pandas，BioPython，matplotlib和其他科学软件包，甚至完整的Anaconda或Enthought python发行版。这使您可以停留在Python环境中，并为您提供所需的大多数功能。
2. 同时，您将需要R的大量专用软件包，因此花一些时间在交互式环境中学习它。我发现几乎不可能在命令行上掌握基本的R，但是RStudio以及Quick-R和Learn-R的教程使我的发展非常迅速。

一旦知道了两者，就可以使用rpy2进行魔术操作，而无需担心跨语言调试。

新资源

2015年1月29日更新

事实证明，此答案很受欢迎，因此我认为指出最近的两个资源会很有用：

• 拉尔夫·海因克尔（Ralph Heinkel）在2014年欧洲_Python_ 大会上就此主题进行了精彩演讲。有关 将Python和R的强大功能结合在一起的 视频可在EuroPython YouTube频道上找到。引用他：

三元组R，Rserve和pyRserve允许建立从Python到R的网桥：现在可以从Python调用R函数，就像它们是在Python中实现的一样，甚至可以通过此连接执行完整的R脚本。

• 现在可以将R和Python结合使用rmagic，从而IPython/Jupyter大大简化了产生可重现的研究工作和结合两种语言的笔记本的工作。