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vcf 文件拼接(snp、indel)

方恺
2023-12-01
    bgzip -c raw_snp_vcf > raw_snp_bgzip.gz
    bcftools index raw_snp_bgzip.gz
    bgzip -c raw_indel_vcf > raw_indel_bgzip.gz
    bcftools index raw_indel_bgzip.gz
    bcftools concat -a -D raw_snp_bgzip.gz raw_indel_bgzip.gz -o ${raw_snp_indel_vcf}    

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