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imagej得到灰度图数据_IMAGE J灰度分析

茹高义
2023-12-01

IMAGE J

灰度分析

DNA

灰度分析

方法

1

1.

首先打开软件后,开启图档;

2.

请先做校正,

选择

Analyze

底下的

Calibrate

选项,

再选择校正的模式,

使用

Uncalibrate

OD

,再按

ok

3.

(first

lane)

(

)

Analyze/Gels/select first Lane

快速键

(Ctr+1)

此时框架中会出现一个号码

1

之后可以移动框

架到第二个

lane

再选择

Analyze/Gels/select second Lane

快速键

(Ctr+2)

当然可以一直加下去,

最后按

Analyze/Gels/plot Lanes

快速键

(Ctr +3)

4.

分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,

此时可以看到有几个比较高的

区段,

就是我们想定量的

band

使用直线工具

(

工具列第五个选项

)

先将图形中高点为有

band

的区域和没有

band

的区域分开再,

使用魔术棒工具

(

工具列第八个选项

)

点选要分析的区域;

5.

当我们点选分析时,在

result

的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每

band

的值。

方法

2

1.

打开图

2.

选择要分析的条带,

Ctrl+M

WB

灰度分析

1.

打开文件;

2.

把图片转化成灰度图片:

Image>Type

8-bit

3.

消除背景影响:

Process>Subtract Background.

选择

50

基本可以。

4.

设置定量参数:

Analyze>Set

Measurements,

点击面积,平均密度,和灰度值及

Integrated Density

5.

设置单位

Analyze>Set Scale,

在“

Unit of length

边的方框里输入

"pixels"

6.

把图片转换成亮带,

Edit>Invert

7.

选择

Freehand Selection

;尽量把条带圈起来;

点击键盘

m

,出来

IntDen

灰度值;

8.

用“

Freehand Selection

”选择下一条带,按

m

进行测量。

11.

当测定完所有条带,选结果中的“

Edit

”的“

Select

All

,然后复制数据“

IntDen

Excel

表即可进行分析。

Merge

1.

打开文件;

2. Image

color

merge channels

3.

同样的要把输出的彩色图像名字为

composite

类型变为

RGB color Iamge

--

type

--

RGB

color

4.

然后

ctrl+S

保存就可以了。

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