bedtools、getfasta
ref
bedtools getfasta doc
note
安装：
conda install bedtools
参考文件：
需要提前下载好fasta文件
最好有fai索引文件（bedtools也会自动生成）
语法：
bedtools getfasta [OPTIONS] -fi <input FASTA> -bed <BED/GFF/VCF>
如：
bedtools getfasta -fi <input FASTA> -bed <BED/GFF/VCF> -fo out.fa
