GENIE安装
一、genie简介
genie是使用蒙特卡洛方法模拟中微子物理的现代化软件。具体用途有请罗昊同学讲解。
二、genie安装
genie的安装是比较复杂的，关键原因是genie依赖软件包比较多，而且依赖软件包之间存在相互连接的现象。
例如：genie依赖于ROOT，ROOT编译的时候需要链接pythia6之后再编译。
但是安装过程只要一步步来，耐心细心，解决出现的问题，就不难成功安装。
1.安装依赖包
需要的依赖包如下：
- log4cpp：记录C++程序的日志和调试
- GSL：GNU的科学计算库
- LHAPDF6：计算夸克打碎的物理过程
- pythia6：描述各种基本粒子相互碰撞过程
- libxml2：支持使用可扩展标记语言（xml）存储数据
- ROOT：数据分析软件
-------以下操作均在/opt目录下-------
(1)安装log4cpp
下载安装包：
wget https://sourceforge.net/projects/log4cpp/files/latest/download
解压：
tar –xvf log4cpp-1.1.3.tar.gz
规范命名：
mv log4cpp-1.1.3 log4cpp-1.1.3-src (-src表示源代码目录)
mkdir log4cpp-1.1.3 (无-src表示安装目录)
编译安装：
cd ../log4cpp-1.1.3-src
./autogen.sh
./configure --prefix=/opt/log4cpp-1.1.3
make
make install
(2)安装GSL
理论上也可以安装log4cpp的办法安装GSL，但是可以直接用apt安装(Debian、Ubuntu)
sudo apt install libgsl-dev
(3)安装LHAPDF6
下载安装包：
wget https://lhapdf.hepforge.org/downloads/?f=LHAPDF-6.2.3.tar.gz
解压：
tar –xvf LHAPDF-6.2.3.tar.gz
规范命名：
mv LHAPDF-6.2.3 LHAPDF-6.2.3 -src
mkdir LHAPDF-6.2.3
编译安装：
cd ../ LHAPDF-6.2.3 -src
./configure --prefix=/opt/LHAPDF-6.2.3
make
make install
(4)安装pythia6
pythia6是个相当古老的软件包，它使用Fortran77编写，在2007年已经被用C++重写的pythia8代替，但是没有办法，genie要求pythia6
这里提供一个简单安装pythia6的方法：
下载：点击这里
原地址已不能使用，请使用https://root.cern.ch/download/pythia6.tar.gz
编译：
Linux: ./makePythia6.linux(按照命名来说，64位Linux应该是./makePythia6.linuxx8664，但是我用前者也可以)
macos: ./makePythia6.macosx(按照命名来说，64位macos应该是./makePythia6.macosx64，但是我两个都没试)
编译之后生成： libPythia6.so 即为需要的pythia6库文件。
注意编译过程可能遇到g77错误，把对应的make文件里g77改成gfortran
(5)安装libxlm2
下载安装包：
wget ftp://xmlsoft.org/libxml2/libxml2-2.8.0.tar.gz
解压：
tar –xvf libxml2-2.8.0.tar.gz
规范命名：
mv libxml2-2.8.0 libxml2-2.8.0-src
mkdir libxml2-2.8.0
编译安装：
cd ../ libxml2-2.8.0 -src
./configure --prefix=/opt/libxml2-2.8.0
make
make install
(6)安装ROOT
下载安装包：
wget https://root.cern/download/root_v6.20.04.source.tar.gz
解压：
tar –xvf root_v6.20.04.source.tar.gz
规范命名：
mv root_v6.20.04 root-6.20.04-src
mkdir root-6.20.04
编译安装：
cd ../ root-6.20.04
cmake ../ root-6.20.04-src
-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/opt/root-6.20.04
-Dbuiltin_gsl=ON -Dmathmore=ON -Dpythia6=ON
-DPYTHIA6_LIBRARY=/opt/pythia6/libPythia6.so
-DLIBXML2_INCLUDE_DIR=/opt/libxml2-2.8.0/include/libxml2
-DLIBXML2_LIBRARY=/opt/libxml2-2.8.0/lib/libxml2.so
cmake的时候需要注意gsl和mathmore要打开，XML2的路径写到哪里也需要准确。
不是安装过gsl了吗？为什么这里gsl还要打开？我也不清楚，有时间可以测试gsl不打开的效果。
我是使用cmake-gui配置，注意PYTHIA6_LIBRARY设置一定要正确，我还遇到gfortan库中函数未定义的问题，最后发现是pythia6不能从pythia官网下载，需要从ROOT官网下载。
顺利的话就可以编译安装：
make
make install
准备好电影好好享受编译过程！
2.编译安装genie
总言：genie的安装和一般GNU软件安装方法一样，都是 ./configure&&make&&make install
(1)下载genie安装包
git clone https://github.com/GENIE-MC/Generator.git
如果下载太慢可以选择下面链接(同步于2020-4)
git clone https://gitee.com/zhaoww7/genieGenerator
您也可以先把github仓库导入国内gitee仓库，然后从gitee下载
总而言之，您如果在/opt目录下载，会得到/opt/genieGenerator
、
另外创建/opt/genie作为您的安装目录。
(1)设置环境变量
genie安装前需要设置环境变量，目的是genie安装过程中可以寻找到依赖包：
$GENIE=/opt/genieGenerator：注意这里是genie源代码位置(存疑)
$ROOTSYS=/opt/root-6.20.04 ：ROOT的安装位置
将下列路径添加到 LD_LIBRARY_PATH :
$GENIE/lib、$ROOTSYS/bin、$/opt/pythia6/libPythia6.so、/opt/libxml2-2.8.0/lib、/opt/log4cpp/lib
添加方法： export LD_LIBRARY_PATH=$GENIE/lib:$LD_LIBRARY_PATH 以此类推
将下列路径添加到 PATH :
$ROOTSYS/bin、$GENIE/bin
添加方法： export PATH=$ROOTSYS/bin：$GENIE/bin:$PATH
也可以将上面的环境设置写入~/.bashrc(linux用户)
(2)配置genie
官方给出的配置方法如下：
./configure --prefix=/opt/genie ## 安装目录 --disable-profiler --enable-gfortran ## 记得打开gfortran --with-gfortran-lib=/usr/lib/x86_64-linux-gnu ## 使用 ldconfig -p | grep libfortran 找到gfortran库位置写上 --disable-lhapdf5 --enable-lhapdf6 --disable-validation-tools --disable-cernlib --enable-lhapdf --enable-flux-drivers --enable-geom-drivers --disable-doxygen --enable-test --enable-mueloss --enable-dylibversion --enable-t2k --enable-fnal --enable-atmo --enable-nucleon-decay --disable-masterclass --disable-debug --with-optimiz-level=O2 --with-pythia6-lib=/opt/pythia6 --with-lhapdf6-inc=/opt/LHAPDF-6.2.3/include --with-lhapdf6-lib=/opt/LHAPDF-6.2.3/lib --with-libxml2-inc=/opt/libxml2-2.8.0/include/libxml2 --with-libxml2-lib=/opt/libxml2-2.8.0/lib --with-log4cpp-inc=/opt/log4cpp-1.1.3/include --with-log4cpp-lib=/opt/log4cpp-1.1.3/lib
官网上还有一句话：看起来一切默认就能安装。
不过我建议最好不要缺少gfortran和inc、lib的路径。
(3)编译genie
如果上面 ./configure 没有报错，那么恭喜你已经半只脚踏入成功的大门了，编译只需：
make -j4
同样的，这里是4还是其他取决于你的电脑CPU核数
(4)安装genie
将编译好的文件复制到/opt/genie
make install
一切顺利？恭喜恭喜！
三、genie使用
留白也是艺术
本文基本内容从genie导入，后增加自己注释而成；侵权请联系本人删除。