RDKit | 基于RDKit的随机SMILES的生成

环境

系统：Windows 10 （x64）

Python： Python3.7

RDKit：2019.09.3

 

基于RDKit的随机smiles生成

导入库

import sys
import os
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
from rdkit.Chem.Draw import IPythonConsole
from rdkit import rdBase
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline

rdkit版本：

print(rdBase.rdkitVersion)

2019.09.3

载入数据绘制分子

testsmi = 'CC(C1=C(C=CC(=C1Cl)F)Cl)OC2=C(N=CC(=C2)C3=CN(N=C3)C4CCNCC4)N'
mol = Chem.MolFromSmiles(testsmi)
mol