python科研_Mountail Lion 上的 Python 科研环境的搭建

先用 pip 安装 numpy：pip install numpy

查看 numpy 的版本和路径：import numpy

print numpy.__version__

print numpy.__file__1.6.2

/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/numpy/__init__.pyc

scipy 的安装相对要麻烦一些。mountain lion 下直接 pip install scipy 有问题，相关的问题在 scipy 的git 版本中已经得到修正，因此要用下面的命令安装 github 上的 dev 版本：pip install -e git+https://github.com/scipy/scipy#egg=scipy-dev

这时可能会出现下面的错误：numpy.distutils.npy_pkg_config.PkgNotFound: Could not find file(s) ['/usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/lib/npy-pkg-config/npymath.ini']

我的解决方法是，重新下载一个 numpy 的源码（版本和前面安装的相同），解开后进行 build：python setup.py build

在 build 目录下面的src.macosx-10.8-intel-2.7/numpy/core/lib/npy-pkg-config/ 下能找到这个文件 npymath.ini，把这个 npy-pkg-config 目录都 copy 到 usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/numpy/core/lib 下面，继续前面的安装，就能够克服这个问题。但在编译的最后，发现无法找到 libnpymath 库，这个库可以在 build 目录下的 temp.macosx-10.8-intel-2.7 里找到 libnpymath.a ，同样把它 copy 到 上面的 core/lib 目录下，继续 pip 就成功了。

检查 scipy 的版本：import scipy

print scipy.__version__

print scipy.__file__0.12.0.dev-5c40ff8

/Users/xxh/src/scipy/scipy/__init__.pyc

可见编译的 dev 版本没有把文件都复制到 usr/local… 下，而是保留在原地，在 /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages 下放了个 scipy.egg-link 。