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安装R v4.0.2后save_kable不起作用

朱季
2023-03-14

以前,我曾成功地使用kableExtra中的save_kable()将latex表导出到*.png中。但是,将R更新到4.0.2版后,save_kable始终以R致命错误结束(没有显示特定的错误消息,会话只是中止)。我安装了一个干净的R3.6.3版本,一切正常。

接下来,我重新安装了MikTEX,但这似乎不是问题所在,因为R Markdown可以创建一个没有问题的.pdf文件(在4.0.2版本中)。此外,使用带有“html”选项的save_kable也可以很好地将表导出到.png中。这个问题似乎是针对乳胶的。

查看sessionInfo(),唯一的区别是R3.6.3会自动加载“magick”包,而R4.0.2不会。但是,在后一个R版本中手动加载magick包并不能解决问题。当然,这些会话在“编译器”包版本中有所不同。也许这就是问题的根源?

任何帮助都将不胜感激。这个问题可以用最少的代码重现,例如

kable(mtcars, "latex") %>%  save_kable("test.png")

这里是会议信息

R version 4.0.2 (2020-06-22)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 19041)

Matrix products: default

Random number generation:
 RNG:     Mersenne-Twister 
 Normal:  Inversion 
 Sample:  Rounding 
 
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252   
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C                          
[5] LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] magick_2.4.0     kableExtra_1.1.0

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] Rcpp_1.0.5        rstudioapi_0.11   knitr_1.29        xml2_1.3.2        magrittr_1.5     
 [6] hms_0.5.3         rvest_0.3.5       munsell_0.5.0     viridisLite_0.3.0 colorspace_1.4-1 
[11] R6_2.4.1          rlang_0.4.7       stringr_1.4.0     httr_1.4.1        tools_4.0.2      
[16] webshot_0.5.2     xfun_0.15         htmltools_0.5.0   ellipsis_0.3.1    digest_0.6.25    
[21] tibble_3.0.3      lifecycle_0.2.0   crayon_1.3.4      readr_1.3.1       vctrs_0.3.2      
[26] glue_1.4.1        evaluate_0.14     rmarkdown_2.3     stringi_1.4.6     compiler_4.0.2   
[31] pillar_1.4.6      scales_1.1.1      pkgconfig_2.0.3  

共有1个答案

梁磊
2023-03-14

这似乎是windows特有的问题。事实上,我最近在这里问了一个问题:Rmarkdown和kable_save()中的kableExtra HTML样式我看到的一些可能的修复方法列在那里,比如更新ghostscript,不使用tinytext,更新一些latex包,包括“独立”包,并在ImageMagick ImageMagick安全策略“PDF”中编辑policy.xls文档,阻止转换。

这些都不适合我,当我尝试将latex格式保存到png时,我遇到了同样的崩溃问题。然而,其他一些Windows用户已经通过上述步骤获得了成功,所以不妨尝试一下,看看效果如何。

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