通过shell函数从R发出的UNIX命令
我需要从R会话发出unix命令。我在Windows R2 2012服务器上使用RStudio 1.1.383和R3.4.3。
shell()函数对我来说似乎是正确的，但是当我指定bash shell的路径（从Git for Windows install）时，命令失败，错误代码为127。
shell_path <- "C:\\Program Files\\Git\\git-bash.exe"
shell("ls -a", shell = shell_path)
## running command 'C:\Program Files\Git\git-bash.exe /c ls -a' had status 127'ls -a' execution failed with error code 127
非常确定我的shell路径是正确的：
编辑：
在2018-03-09打了一些比赛后：
shell(cmd=“ls-a”,shell='“c：/program files/git/bin/bash.exe”‘,internative=TRUE,flag=“-c”）
在RStudio中，我们还可以使用knitr调用bash，并设置块选项：
库(knitr)
```{bash my_bash_chunk, engine.path="C:\\Program Files\\Git\\bin\\bash.exe"}
# Using a call to unix shell
ls -a
```
共有1个答案
这里有两件事很突出。如果没有找到命令，Bash将返回退出代码127；您应该尝试运行完全限定的命令名。
我还看到shell是用/c标志运行的。根据文档，标志参数指定“在shell下运行命令的开关”，它的默认值为/c，但是“如果shell是bash或tcsh或sh，默认值将更改为'-c'。”显然，git-bash.exe不会出现这种情况。
尝试以下更改：
shell_path <- "C:\\Program Files\\Git\\git-bash.exe"
shell("/bin/ls -a", shell = shell_path, flag = "-c")
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