如何防止runnable JAR中出现“java.library.path中没有jhdf5”错误

Question

我有一个Java程序，可以读取和处理HDF5文件。在Eclipse（windows OS）上运行时，我遇到了以下错误，必须添加一个运行配置VM参数（-Dncsa.hdf.hdf5lib.H5.hdf5lib=\jhdf5.dll）才能添加库并正常运行。现在我正在导出一个可运行的Jar文件，我再次遇到错误，可能是因为它没有继承VM参数。

java.lang.UnsatisfiedLinkError: no jhdf5 in java.library.path
    at java.lang.ClassLoader.loadLibrary(Unknown Source)
    at java.lang.Runtime.loadLibrary0(Unknown Source)
    at java.lang.System.loadLibrary(Unknown Source)
    at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.loadH5Lib(H5.java:347)
    at ncsa.hdf.hdf5lib.H5.<clinit>(H5.java:274)
    at ncsa.hdf.hdf5lib.HDF5Constants.<clinit>(HDF5Constants.java:28)
    at ncsa.hdf.object.h5.H5File.<init>(H5File.java:99)
    at ncsa.hdf.object.h5.H5File.<init>(H5File.java:132)
    at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance(Unknown Source)
    at sun.reflect.DelegatingConstructorAccessorImpl.newInstance(Unknown Source)
    at java.lang.reflect.Constructor.newInstance(Unknown Source)
    at java.lang.Class.newInstance(Unknown Source)
    at ncsa.hdf.object.FileFormat.<clinit>(FileFormat.java:229)
    at hdf5Tool.HDF5Interface.readNodeStructureH5(HDF5Interface.java:73)
    at wizardPages.DREAMWizard$STORMData$1.run(DREAMWizard.java:340)
    at org.eclipse.jface.operation.ModalContext$ModalContextThread.run(ModalContext.java:122)

基于这篇文章，我看到了两个可能的选择：创建一个shell脚本或应用程序包来合并VM参数。

然而，我很好奇有没有更简单的方法来识别可运行JAR文件的库。有什么建议吗？

Answer 1

不确定您是否有特定的需求，但也许可以检查一下jhdf.io它是一个纯Java的HDF5库，因此不需要加载本机库。用标准依赖项添加到Maven或Gradle项目应该很简单。

这是一个相当早期的阶段，但应该支持从大多数HDF5文件中读取数据，如果它不工作，就会出现问题。

免责声明：我是jhdf的作者，所以可能有偏见。