如何从python文件运行bash脚本？[重复]

Question

我想从python脚本内部运行下面的bash脚本。

condo activate bne
CUDA_VISIBLE_DEVICES=1 python bne.py --model models/BNE_SGsc --fe ./embeddings/BioEmb/Emb_SGsc.txt --fi names.txt --fo output_BNE_SGsc.txt

我的python脚本/函数如下所示

def do_tensorflow_routine(path_name_file):
    os.chdir(os.path.join("../","bne_resources/"))
    os.system("conda activate bne")
    bne_command = "python bne.py --model models/BNE_SGsc --fe ./embeddings/BioEmb/Emb_SGsc.txt --fi names.txt --fo names_bne_SGsc.txt"
    subprocess.run(bne_command,shell=True)
    pass

但是，我收到以下错误 -

CommandNotFoundError: Your shell has not been properly configured to use 'conda activate'.
To initialize your shell, run

    $ conda init <SHELL_NAME>

Currently supported shells are:
  - bash
  - fish
  - tcsh
  - xonsh
  - zsh
  - powershell

See 'conda init --help' for more information and options.

IMPORTANT: You may need to close and restart your shell after running 'conda init'.

我正在使用集群，我的系统规格如下 -

   Static hostname: lab1
         Icon name: computer-server
           Chassis: server
        Machine ID: 104265a0ea5b48c1a3c5a9802294af66
           Boot ID: 4277780744ae448292d66a9ff39c76e2
  Operating System: Ubuntu 20.04.1 LTS
            Kernel: Linux 5.8.0-36-generic
      Architecture: x86-64

如果我遗漏了什么，请告诉我。我的基本问题是如何从给定的python脚本运行另一个python script，特别是当我们需要激活和停用虚拟环境时，因为由于一些依赖冲突，父python script和子python cript需要两个不同的虚拟环境。请帮帮我。提前谢谢，梅格

Answer 1

如果终端在运行 conda 激活 bne 后未显示（基站），请尝试运行：

< code>conda init

在顶部的 bash 脚本中，你需要舍邦行 #！/usr/bin/env bash 和 env 用于不同 Linux 发行版的可移植性。