如何在事务中批量插入GraphDB中的数据
我试图将数据插入GraphDB，因此SPARQL更新查询由总大小约为1M的语句组成，并带有一些DELETE和WHERE语句。我使用GraphDB REST API执行此操作失败：
1） 成功启动了发送更新请求（python代码段）的事务处理POST/repositories/{repositoryID}/transactions 2）
requests.put(
url='/repositories/{repositoryID}/transactions/{transactionID}'
params={'update': sparql, 'action': 'ADD'}
)
获取错误
<!doctype html><html lang="en"><head><title>HTTP Status 400 – Bad Request</title><style type="text/css">h1 {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;color:white;background-color:#525D76;font-size:22px;} h2 {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;color:white;background-color:#525D76;font-size:16px;} h3 {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;color:white;background-color:#525D76;font-size:14px;} body {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;color:black;background-color:white;} b {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;color:white;background-color:#525D76;} p {font-family:Tahoma,Arial,sans-serif;background:white;color:black;font-size:12px;} a {color:black;} a.name {color:black;} .line {height:1px;background-color:#525D76;border:none;}</style></head><body><h1>HTTP Status 400 – Bad Request</h1><hr class="line" /><p><b>Type</b> Exception Report</p><p><b>Message</b> Request header is too large</p><p><b>Description</b> The server cannot or will not process the request due to something that is perceived to be a client error (e.g., malformed request syntax, invalid request message framing, or deceptive request routing).</p><p><b>Exception</b></p><pre>java.lang.IllegalArgumentException: Request header is too large
此Sparql语句成功地执行在工作台SPARQL控制台。但是如果我增加我得到的数据数量
java.lang.StackOverflowError
在工作台UI中。
我想执行的Sparql是以下的
PREFIX time: <http://www.w3.org/2006/time#>
PREFIX xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#>
PREFIX tr: <http://www.semanticweb.org/tr#>
PREFIX owl: <http://www.w3.org/2002/07/owl#>
PREFIX geosparql: <http://www.opengis.net/ont/geosparql#>
DELETE { tr:ontologyVersion tr:hasTimestamp ?o . }
INSERT {
trip:ontologyVersion a time:Instant, owl:NamedIndividual ;
trip:hasTimestamp "2019-10-11 14:56:06.750130+00:00"^^xsd:dateTime .
<a lot of new triples>
}
WHERE {
OPTIONAL { tr:ontologyVersion tr:hasTimestamp ?o . }
}
那么，如何将数据插入GraphDB，正确的方法是什么？
更新1
我重写了代码以便使用
requests.put(url=url, data={'update': sparql}, params={'action': 'COMMIT'})
并使用sparql=“删除数据{}；插入数据{}”。请求已完成，响应代码为200，但由于某些原因，数据不在GraphDB中。
更新2
根据rdf4j服务器RESTAPI，我将请求更改为
requests.put(url=transaction_url, data={'update': sparql}, params={'action': 'UPDATE'})
requests.put(url=transaction_url, params={'action': 'COMMIT'})
并且仍然使用sparql=“删除数据{}；插入数据{}”。内容类型为“application/x-www-form-urlencoded”和url编码的sparql字符串的请求。
在这种情况下，我得到406个错误
org.eclipse.rdf4j.http.server.ClientHTTPException: Could not read SPARQL update string from body.
共有2个答案
最后，我想出了解决办法。
requests.put(url=transaction_url, data=sparql, params={'action': 'UPDATE'}, headers={'Conteny-Type': 'application/sparql-update'})
requests.put(url=transaction_url, params={'action': 'COMMIT'})
事实证明，RDF4J transactions API希望查询按原样位于主体中，而不使用任何urlencoding和“update=”参数名。在这里找到java/org/eclipse/rdf4j/http/server/repository/transaction/TransactionController。JAVA
这里有两个不同的问题。
第一个问题是当您尝试将sparql更新作为事务的一部分执行时。错误消息是“请求头太大”。对我来说，这听起来像是您的请求试图将负载作为头字段发送，而不是作为数据负载发送。我认为您可能需要稍微更改Python代码，例如：
requests.put(
url='/repositories/{repositoryID}/transactions/{transactionID}'
data={'update': sparql, 'action': 'ADD'}
)
（因此是数据而不是参数）
第二个问题听起来像是工作台UI的一个限制（假设这就是抛出StackOverflowerError的原因），但除此之外，插入新数据的方式效率非常低：作为批量数据上载的一部分，您正在执行可选查询，并且使用插入。。。在哪里也一样。
我建议改为使用INSERT DATA命令进行批量上传：
INSERT DATA {
// ... large amount of triples
}
如果您使用时间戳所做的这件事应该是您试图实现的一部分，我建议您在批量上传之前或之后，作为单独的操作来查询和更新该时间戳-如果您在同一事务上执行此操作，最终结果将是相同的。
哦，当然，一旦完成，就需要提交事务。
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