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问题:

如何在ImageJ中裁剪堆栈而不首先复制

司马耘豪
2023-03-14

我使用imageJ对活细胞进行自动显微镜检查。

显微镜将工作台置于所需细胞的中心,取一个Z形叠层,并将该叠层传递给imageJ。

然后我想使用“分析粒子”输出每个Z切片中的单元面积。(这很有效)

为此,我使用执行以下操作的宏:

  1. 选择一个区域

这一切都很好,除了复制步骤对于管道来说太慢。我需要以某种方式避免重复步骤。

有没有办法在不首先复制的情况下裁剪堆栈?(目前这会丢失除一个切片之外的所有切片的信息)

或者,我是否可以应用阈值并仅对选定区域分析粒子?

共有1个答案

公孙令秋
2023-03-14

裁剪堆栈可以在宏中使用run(“裁剪”) 遵循适当的选择。

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