仅打包使用Cython编译的python库的二进制编译.so文件

Question

我有一个包mypack，里面有一个模块mymod.py，和__init__.py。出于某些原因，这是没有争议的，我需要打包编译的模块（不允许使用.py或.pyc文件）。也就是说，__init__.py是分布式压缩文件中允许的唯一源文件。

文件夹结构为：

. 
│  
├── mypack
│   ├── __init__.py
│   └── mymod.py
├── setup.py

我发现Cython可以做到这一点，方法是将.so库中的每个.py文件转换为可以直接用python导入的.so库。

问题是：setup.py文件必须怎样才能便于打包和安装？

目标系统具有virtualenv，必须使用允许轻松安装和卸载的任何方法安装软件包（欢迎使用easy_install，pip等）。

我尽了一切可能。我阅读setuptools并distutils记录了所有与stackoverflow相关的问题，并尝试了各种命令（sdist，bdist，bdist_egg等），并在文件条目中使用了setup.cfg和MANIFEST.com的许多组合。

我得到的最接近的是下面的安装文件，该文件将bdist_egg命令子类化，以便同时删除.pyc文件，但这破坏了安装。

如果覆盖了正确安装中包含的所有辅助文件（我需要pip freeze在venv中运行，请参见参考资料
mymod==0.0.1），那么“手动”安装venv文件的解决方案也不错。

使用以下命令运行它：

python setup.py bdist_egg --exclude-source-files

并（尝试）使用

easy_install mymod-0.0.1-py2.7-linux-x86_64.egg

您可能会注意到，目标是使用python 2.7的linux 64位。

from Cython.Distutils import build_ext
from setuptools import setup, find_packages
from setuptools.extension import Extension
from setuptools.command import bdist_egg
from setuptools.command.bdist_egg import  walk_egg, log 
import os

class my_bdist_egg(bdist_egg.bdist_egg):

    def zap_pyfiles(self):
        log.info("Removing .py files from temporary directory")
        for base, dirs, files in walk_egg(self.bdist_dir):
            for name in files:
                if not name.endswith('__init__.py'):
                    if name.endswith('.py') or name.endswith('.pyc'):
                        # original 'if' only has name.endswith('.py')
                        path = os.path.join(base, name)
                        log.info("Deleting %s",path)
                        os.unlink(path)

ext_modules=[
    Extension("mypack.mymod", ["mypack/mymod.py"]),
]

setup(
  name = 'mypack',
  cmdclass = {'build_ext': build_ext, 
              'bdist_egg': my_bdist_egg },
  ext_modules = ext_modules,
  version='0.0.1',
  description='This is mypack compiled lib',
  author='Myself',
  packages=['mypack'],
)

更新。在@Teyras答案之后，可以按照答案中的要求构建轮子。该setup.py文件内容如下：

import os
import shutil
from setuptools.extension import Extension
from setuptools import setup
from Cython.Build import cythonize
from Cython.Distutils import build_ext

class MyBuildExt(build_ext):
    def run(self):
        build_ext.run(self)
        build_dir = os.path.realpath(self.build_lib)
        root_dir = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__))
        target_dir = build_dir if not self.inplace else root_dir
        self.copy_file('mypack/__init__.py', root_dir, target_dir)

    def copy_file(self, path, source_dir, destination_dir):
        if os.path.exists(os.path.join(source_dir, path)):
            shutil.copyfile(os.path.join(source_dir, path), 
                            os.path.join(destination_dir, path))


setup(
  name = 'mypack',
  cmdclass = {'build_ext': MyBuildExt},
  ext_modules = cythonize([Extension("mypack.*", ["mypack/*.py"])]),
  version='0.0.1',
  description='This is mypack compiled lib',
  author='Myself',
  packages=[],
  include_package_data=True )

关键是要设定packages=[],。需要重写build_extclassrun方法，以使__init__.py文件进入车轮。

Answer 1

不幸的是，公认的设置答案packages=[]是错误的，并且可能破坏很多东西，例如可以在此问题中看到。不要使用它。而不是从dist中排除所有软件包，您应该仅排除将被cythonized并编译为共享对象的python文件。

下面是一个工作示例；它使用我的食谱中的问题从python
bdist_egg或bdist_wheel中排除单个源文件。示例项目包含spam具有两个模块的软件包spam.eggs和spam.bacon，以及spam.fizz具有一个模块的子软件包spam.fizz.buzz：

root
├── setup.py
└── spam
    ├── __init__.py
    ├── bacon.py
    ├── eggs.py
    └── fizz
        ├── __init__.py
        └── buzz.py

模块查找是在build_py命令中完成的，因此您需要使用自定义行为对其进行子类化。

简单案例：编译所有源代码，不例外

如果您要编译每个.py文件（包括__init__.pys），则覆盖build_py.build_packages方法已经足够，使其成为noop。由于build_packages不执行任何操作，因此根本不会.py收集任何文件，并且dist将仅包含cythonized扩展名：

import fnmatch
from setuptools import find_packages, setup, Extension
from setuptools.command.build_py import build_py as build_py_orig
from Cython.Build import cythonize


extensions = [
    # example of extensions with regex
    Extension('spam.*', ['spam/*.py']),
    # example of extension with single source file
    Extension('spam.fizz.buzz', ['spam/fizz/buzz.py']),
]


class build_py(build_py_orig):
    def build_packages(self):
        pass


setup(
    name='...',
    version='...',
    packages=find_packages(),
    ext_modules=cythonize(extensions),
    cmdclass={'build_py': build_py},
)

复杂的情况：将cythonized扩展与源模块混合

如果只想编译选定的模块，而其余的都保持不变，那么您将需要更复杂的逻辑。在这种情况下，您需要覆盖模块查找。在下面的例子中，我仍然编译spam.bacon，spam.eggs和spam.fizz.buzz对共享对象的，但假__init__.py文件不变，所以它们将被包括作为源模块：

import fnmatch
from setuptools import find_packages, setup, Extension
from setuptools.command.build_py import build_py as build_py_orig
from Cython.Build import cythonize


extensions = [
    Extension('spam.*', ['spam/*.py']),
    Extension('spam.fizz.buzz', ['spam/fizz/buzz.py']),
]
cython_excludes = ['**/__init__.py']


def not_cythonized(tup):
    (package, module, filepath) = tup
    return any(
        fnmatch.fnmatchcase(filepath, pat=pattern) for pattern in cython_excludes
    ) or not any(
        fnmatch.fnmatchcase(filepath, pat=pattern)
        for ext in extensions
        for pattern in ext.sources
    )


class build_py(build_py_orig):
    def find_modules(self):
        modules = super().find_modules()
        return list(filter(not_cythonized, modules))

    def find_package_modules(self, package, package_dir):
        modules = super().find_package_modules(package, package_dir)
        return list(filter(not_cythonized, modules))


setup(
    name='...',
    version='...',
    packages=find_packages(),
    ext_modules=cythonize(extensions, exclude=cython_excludes),
    cmdclass={'build_py': build_py},
)