R：rJava软件包安装失败

Question

使用install.packages("rJava")命令安装rJava时，出现以下错误：

checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver    : '/usr/bin/jar'
compiler    : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags   : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'
java libs   : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... yes
checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’

我已经安装了Java JDK，并java -version返回以下内容：

$ java -version
java version "1.6.0_20"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)

当谷歌搜索错误时，我看到其他人也遇到了同样的问题，但是除了我已经完成的“安装整个JDK，而不仅仅是JRE”之外，没有找到解决方案。

我读过的另一件事是运行sudo R CMD javareconf，它运行愉快，没有错误。

任何想法我的问题是什么？

[[编辑]] 自从我遇到这个问题已经几个月了。我最初是通过编辑Java路径来解决此问题的，如下面发布的答案所示。我最近在安装新的Ubuntu时遇到了同样的问题。我尝试了Dirk的建议，以使用apt-get安装rJava软件包。效果很好。最初我没有意识到的是，使用Ubuntu apt-get方法安装软件包与使用R内的install.packages（）加载同一软件包根本不同。Ubuntu软件包解决了一些我没有意识到或欣赏的问题。

Answer 1

apt-get install r-cran-rjava

容易些吗？