将NetworkX与matplotlib.ArtistAnimation一起使用

Question

我想做的是创建一个动画，其中图形的节点随时间改变颜色。当我在matplotlib中搜索有关动画的信息时，通常会看到类似以下示例的示例：

#!/usr/bin/python

import numpy as np
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import ArtistAnimation

fig = plt.figure(figsize=(8,8))
images = []
for i in range(10):
  data = np.random.random(100).reshape(10,10)
  imgplot = plt.imshow(data)
  images.append([imgplot])
anim = ArtistAnimation(fig, images, interval=50, blit=True)
anim.save('this-one-works.mp4')
plt.show()

所以我想我可以做这样的事情：

#!/usr/bin/python

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import ArtistAnimation

G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(0,1),(1,2),(2,0)])
fig = plt.figure(figsize=(8,8))
pos=nx.graphviz_layout(G)
images = []
for i in range(10):
  nc = np.random.random(3)
  imgplot = nx.draw(G,pos,with_labels=False,node_color=nc) # this doesn't work
  images.append([imgplot])
anim = ArtistAnimation(fig, images, interval=50, blit=True)
anim.save('not-this-one.mp4')
plt.show()

我所坚持的是，在使用nx.draw（）绘制图形之后，如何获得适当类型的对象以放入要传递给ArtistAnimation的数组中。在第一个示例中，plt.imshow（）返回类型为matplot.image.AxesImage的对象，但是nx.draw（）实际上不返回任何内容。有没有办法让我接触合适的图像对象？

当然，完全可以接受完全不同的方法（在matplotlib中似乎总是有很多不同的方法来做同样的事情），只要我可以在完成后将动画另存为mp4。

谢谢！

Answer 1

import numpy as np
import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.animation import FuncAnimation

G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(0,1),(1,2),(2,0)])
fig = plt.figure(figsize=(8,8))
pos=nx.graphviz_layout(G)
nc = np.random.random(3)
nodes = nx.draw_networkx_nodes(G,pos,node_color=nc)
edges = nx.draw_networkx_edges(G,pos)


def update(n):
  nc = np.random.random(3)
  nodes.set_array(nc)
  return nodes,

anim = FuncAnimation(fig, update, interval=50, blit=True)

nx.draw不返回任何内容，因此为什么您的方法不起作用。最简单的方法是绘制nodes和edges使用nx.draw_networkx_nodes以及nx.draw_networkx_edges返回PatchCollection和LineCollection对象。然后，您可以使用来更新节点的颜色set_array。

使用相同的总体框架的工作，你也可以左右移动节点（通过set_offsets的PatchCollection和set_verts或set_segments为LineCollection）

我见过的最好的动画教程：http : //jakevdp.github.io/blog/2012/08/18/matplotlib-
animation-tutorial/