biolinux软件安装可参考课程:linux系统使用
虽然原版biolinux已经包含了很多常用生物信息分析软件,但是,还有一些软件没有。因此,我们自行打包了一个biolinux的ova包,在根目录下的biosoft文件夹下我们自己安装了一些软件。方便进行《基因家族分析实操课程》分析。
系统用户及密码:
用户:manager
密码:manager
用户:root
密码:manager
biolinux的虚拟机安装见视频课程:《Linux生信分析环境搭建Bio-linux》
组学大讲堂安装的软件列表,见安装目录 /biosoft:
annovar
annovar2016_06_24
BreakDancer
circos
e-PCR
GATK
java
meme
miniconda
MISA
Primer3
rpm
sratoolkit
vcftools
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