bio-linux_Bio-Linux：稳定，可移植的科学研究Linux发行版
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在2006年7月的《 自然生物技术》论文中介绍并详细介绍了Bio-Linux。 该分布是英国自然环境研究委员会的集体努力。 正如创建者和作者所指出的那样，对高通量“-组学”（基因组，蛋白质组学，代谢组学）科学的分析要求使得必须开发集成计算解决方案来分析大量实验数据。
因此，Bio-Linux诞生了。 根据其创建者的说法，该发行版充当“免费的生物信息学工作站平台，可以安装在从笔记本电脑到大型服务器的任何设备上”。 当前发行版Bio-Linux 8建立在Ubuntu 14.04 LTS基础上。 因此，Bio-Linux的总体外观与Ubuntu相似。
在我自己作为研究免疫学家的工作中，我可以证明Bio-Linux设计和开发中集成软件方法的需求和成功。 Bio-Linux是真正满足现代科学数据管道需求的统包解决方案。 正如该网站所提到的，Bio-Linux包括250多个预安装的软件包 ，其中许多特定于生物信息学数据分析的要求。
到现在为止，您可能会说：“我被卖了，我该如何获得这个惊人的发行版？”
我很高兴你问。 首先，我将在Bio-Linux网站上提供出色的文档。 本文档涵盖了安装说明和使用发行版的非常详尽的概述。
该发行版可以在本地安装和运行，可以通过CD / DVD或USB运行，可以安装在服务器上，也可以在虚拟机环境中运行。 要开始本地安装的安装过程，请下载 Bio-Linux发行版的磁盘映像或ISO 。 磁盘映像是一个3.3GB的文件，具体取决于您的Internet下载速度，这可能是喝杯咖啡或小睡片刻的好时机。
下载完ISO后，Bio-Linux开发人员建议使用UNetBootin ，这是一种免费的跨平台软件包，用于制作可启动USB。 在Bio-Linux网站上为UNetBootin提供了一个链接。 我可以证明UNetBootin在Mac和Linux操作系统中的有效性。
在Unix系列操作系统（Mac OS和Linux）上，还可以使用dd命令从命令行创建可引导的USB：
[sudo umount“ USB位置”
sudo dd bs = 4M if =“ USB位置”的“ ISO位置” conv = fdatasync]
无论使用哪种方法，这可能都是喝咖啡休息的另一个好时机。
在我安装的这一点上，UNetBootin似乎在可启动USB创建期间冻结了squashfs文件。 但是，快速检查Ubuntu磁盘应用程序后，该文件仍在写入USB。 换句话说，请耐心等待-制作可启动USB需要花费一些时间。
喝完咖啡并准备好USB后，就可以使用Bio-Linux了。 正如Bio-Linux网站所指出的那样，如果您尝试在Mac计算机（尤其是较新的硬件版本）上使用可引导USB，则可能无法从USB引导。 有一些解决方法，但是它们涉及将系统配置为双重引导。 同样，在基于Windows的计算机上，可能有必要从BIOS中更改计算机的启动顺序和安全启动设置。
从这一点来看，如何使用发行版由您决定。 您可以从USB运行发行版进行测试。 您可以将发行版安装到计算机上。 您甚至可以按照Bio-Linux网站上的说明来制作发行版的VM实例或在服务器上运行它。 无论您如何使用它，您都可以使用一台高性能的生物信息数据分析工作站。
也许您对这样的工作站有专业的需求，但是即使您从未将Bio-Linux用作专业研究人员，它也可以为各级生物学教学专业人士向学生介绍现代生物信息学原理提供大量资源。 只需一台笔记本电脑和一个USB的价格，每所学校都可以拥有计算机教学资源，以补充“-组学”时代的课堂教学。 您唯一的限制是您的创造力和硬件性能。
更多关于Linux
作为具有强大社区支持的开放源代码操作系统，Linux内核具有许多其他成功的开放源代码软件工作所共有的优势。 Linux趋于稳定并且易于定制。 它也与硬件无关，能够在各种硬件配置上与其他操作系统一起运行。 实际上，安装Linux是从无法运行其他现代操作系统的过时硬件中恢复可用性的常用方法。 Linux也是高度可移植的，可以从任何可引导的外部存储设备（例如USB驱动器）运行，而无需永久安装操作系统。
正是这种稳定性，可定制性和可移植性的组合使我开始使用Linux。 每个Linux操作系统的变体被称为分布 （或发行版 ），它好像有一个Linux发行版的每一个可以想象的计算方案或愿望。 这些选择实际上可能相当吓人，我怀疑它们可能经常使人们不愿尝试Linux。
“可能会有多少种不同的分布？” 你可能想知道。 如果您有几分钟甚至几个小时，请访问DistroWatch.com 。 顾名思义，该站点致力于对与Linux发行版相关的所有事物进行分类。 对于视觉学习者而言，有一个了不起的Linux家族树 ，这确实使它成为了一种观点。
尽管整本书都专门讨论Linux发行版，但是这些差异通常取决于基本安装中包含的软件，软件的管理方式以及影响发行版“外观”的图形差异。 当然，在硬件兼容性，速度和稳定性方面也有一些微妙之处。
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