Kooboo CMS本着功能独立分离的原则，将站点分为三部分组成：用户管理，站点管理和内容数据库管理。各个功能之间既可独立使用，也可以容易组成在一起形成一个完整的系统。
用户管理
管理整个系统内的用户和角色权限定义。管理员在通过用户管理模块管理用户的相关信息，包括：用户名，密码，Email，是否为超级管理员，界面语言。其中，是否为管理员设置是标识该用户是否为系统的超级管理，如果用户为超级管理员则不需受角色限制而拥有系统有所有权限；界面语言设置可用于设置用户的后面管理界面的显示语言。角色管理用于定义角色所能操作的功能。用户与角色的关系，不在用户管理模块中设置。它们的关系是通过站点添加用户时选择的角色来确定，也就是一个用户在不同站点下可能会有不会的角色权限。
站点管理
站点管理是维护与站点相关的配置信息，包括：站点关系，站点配置，用户添加，自定义错误，URL重定向，robots.txt管理，Layout管理，View管理，Html代码块管理，Label管理，脚本管理，皮肤管理，文件管理，页面地址映射，扩展管理，Module管理，页面管理。
内容数据库管理
内容数据库是用于存储网站的动态数据内容，由内容结构定义，工作流定义，内容广播定义，内容维护等功能组成。
注意：一个内容数据库可以被多个站点同时共享使用。