Python模块_PyLibTiff读取tif文件

• Usage example (libtiff wrapper)

from libtiff import TIFF
# to open a tiff file for reading:
tif = TIFF.open('filename.tif', mode='r')
# to read an image in the currect TIFF directory and return it as numpy array:
image = tif.read_image()
# to read all images in a TIFF file:
for image in tif.iter_images(): # do stuff with image
# to open a tiff file for writing:
tif = TIFF.open('filename.tif', mode='w')
# to write a image to tiff file
tif.write_image(image)

• Usage example (pure Python module)

from libtiff import TIFFfile, TIFFimage
# to open a tiff file for reading
tif = TIFFfile('filename.tif')
# to return memmaps of images and sample names (eg channel names, SamplesPerPixel>=1)
samples, sample_names = tiff.get_samples()
# to create a tiff structure from image data
tiff = TIFFimage(data, description='')
# to write tiff structure to file
tiff.write_file('filename.tif', compression='none') # or 'lzw'
del tiff # flushes data to disk

from libtiff import TIFF  
from scipy import misc  
  
##tiff文件解析成图像序列  
##tiff_image_name: tiff文件名；  
##out_folder：保存图像序列的文件夹  
##out_type：保存图像的类型，如.jpg、.png、.bmp等  
def tiff_to_image_array(tiff_image_name, out_folder, out_type):   
            
    tif = TIFF.open(tiff_image_name, mode = "r")  
    idx = 0  
    for im in list(tif.iter_images()):  
        #  
        im_name = out_folder + str(idx) + out_type  
        misc.imsave(im_name, im)  
        print im_name, 'successfully saved!!!'  
        idx = idx + 1  
    return  
  
##图像序列保存成tiff文件  
##image_dir：图像序列所在文件夹  
##file_name：要保存的tiff文件名  
##image_type:图像序列的类型  
##image_num:要保存的图像数目  
def image_array_to_tiff(image_dir, file_name, image_type, image_num):  
  
    out_tiff = TIFF.open(file_name, mode = 'w')  
      
    #这里假定图像名按序号排列  
    for i in range(0, image_num):  
        image_name = image_dir + str(i) + image_type  
        image_array = Image.open(image_name)  
        #缩放成统一尺寸  
        img = image_array.resize((480, 480), Image.ANTIALIAS)  
        out_tiff.write_image(img, compression = None, write_rgb = True)  
          
    out_tiff.close()  
    return   

---

• 用opencv读取

import cv2
cv2.imread("filename",flags)

对于cv2，imread的关于通道数和位深的flags有四种选择：

IMREAD_UNCHANGED = -1#不进行转化，比如保存为了16位的图片，读取出来仍然为16位。
IMREAD_GRAYSCALE = 0#进行转化为灰度图，比如保存为了16位的图片，读取出来为8位，类型为CV_8UC1。
IMREAD_COLOR = 1#进行转化为RGB三通道图像，图像深度转为8位
IMREAD_ANYDEPTH = 2#保持图像深度不变，进行转化为灰度图。
IMREAD_ANYCOLOR = 4#若图像通道数小于等于3，则保持原通道数不变；若通道数大于3则只取取前三个通道。图像深度转为8位
对于多通道TIFF图像，若要保证图像数据的正常读取，显然要选择IMREAD_UNCHANGED作为imread的flags设置值。

安装pylibtiff

---

##PIL使用
导入 Image 模块。然后通过 Image 类中的 open 方法即可载入一个图像文件。如果载入文件失败，则会引起一个 IOError ；若无返回错误，则 open 函数返回一个 Image 对象。现在，我们可以通过一些对象属性来检查文件内容，即：

>>> import Image
>>> im = Image.open("j.jpg")
>>> print im.format, im.size, im.mode
JPEG (440, 330) RGB

Image 类的实例有 5 个属性，分别是：

format: 以 string 返回图片档案的格式（JPG, PNG, BMP, None, etc.）；如果不是从打开文件得到的实例，则返回 None。
mode: 以 string 返回图片的模式（RGB, CMYK, etc.）；完整的列表参见 官方说明·图片模式列表
size: 以二元 tuple 返回图片档案的尺寸 (width, height)
palette: 仅当 mode 为 P 时有效，返回 ImagePalette 示例
info: 以字典形式返回示例的信息

• 函数概貌。
  Reading and Writing Images : open( infilename ) , save( outfilename )
  Cutting and Pasting and Merging Images :
  crop() : 从图像中提取出某个矩形大小的图像。它接收一个四元素的元组作为参数，各元素为（left, upper, right, lower），坐标系统的原点（0, 0）是左上角。
  paste() :
  merge() :

>>> box = (100, 100, 200, 200)
 >>> region = im.crop(box)
 >>> region.show()
 >>> region = region.transpose(Image.ROTATE_180)
 >>> region.show()
 >>> im.paste(region, box)
 >>> im.show()

• 旋转一幅图片：

def roll(image, delta):
    "Roll an image sideways"

    xsize, ysize = image.size

    delta = delta % xsize
    if delta == 0: return image

    part1 = image.crop((0, 0, delta, ysize))
    part2 = image.crop((delta, 0, xsize, ysize))
    image.paste(part2, (0, 0, xsize-delta, ysize))
    image.paste(part1, (xsize-delta, 0, xsize, ysize))

    return image

• 几何变换

>>>out = im.resize((128, 128))                     #
 >>>out = im.rotate(45)                             #逆时针旋转 45 度角。
 >>>out = im.transpose(Image.FLIP_LEFT_RIGHT)       #左右对换。
 >>>out = im.transpose(Image.FLIP_TOP_BOTTOM)       #上下对换。
 >>>out = im.transpose(Image.ROTATE_90)             #旋转 90 度角。
 >>>out = im.transpose(Image.ROTATE_180)            #旋转 180 度角。
>>>out = im.transpose(Image.ROTATE_270)            #旋转 270 度角。

Image 类的 thumbnail() 方法可以用来制作缩略图。它接受一个二元数组作为缩略图的尺寸，然后将示例缩小到指定尺寸。

import os, sys
from PIL import Image

for infile in sys.argv[1:]:
    outfile = os.path.splitext(infile)[0] + ".thumbnail"
    if infile != outfile:
        try:
            im   = Image.open(infile)
            x, y = im.size
            im.thumbnail((x//2, y//2))
            im.save(outfile, "JPEG")
        except IOError:
            print "cannot create thumbnail for", infile

这里我们用 im.size 获取原图档的尺寸，然后以 thumbnail() 制作缩略图，大小则是原先图档的四分之一。同样，如果图档无法打开，则在终端上打印无法执行的提示。

• PIL.Image.fromarray(obj, mode=None)

Creates an image memory from an object exporting the array interface (using the buffer protocol).

If obj is not contiguous, then the tobytes method is called and frombuffer() is used.

Parameters:	
obj – Object with array interface
mode – Mode to use (will be determined from type if None) See: Modes.
Returns:	
An image object.

New in version 1.1.6.

PIL文档

---