在macOS Mavericks 10.9.5上安装xlsx和rJava

Question

在我的Mac上安装rjava是一场真正的噩梦。

我的设置：

MacOS 10.9.5
Java: 7u71 (64 bits dowloaded from Oracle site)
R: R version 3.1.1 (2014-07-10)

首先，在命令行中，我运行了

sudo R CMD javareconf

然后，我跑进去R:

install.packages('rJava')

编译结束时的错误是:

JavaVM -F/opt/local/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n
ld: library not found for -licuuc
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make[2]: *** [libjri.jnilib] Error 1
make[1]: *** [src/JRI.jar] Error 2
make: *** [jri] Error 2
ERROR: compilation failed for package ‘rJava’
* removing ‘/Users/costa/Library/R/3.1/library/rJava’

我尝试了Java 8和Mac默认的java，也得到了同样的错误。

艾德莱斯？

Answer 1

实际上，通过使用Mac二进制文件在我的Macbook上安装rJava（运行OSX Yosemite和R版本3.2.3），我能够完全避免编辑我的环境。首先，在 R 中执行以下操作以安装 rJava：

install.packages("rJava", type = "mac.binary")

大概独立于此，出于某种原因，我不能安装xlsx，直到我第一次安装了< code>xlsxjars依赖项。因此，在R中执行以下操作:

install.packages(c("xlsxjars", "xlsx"))

使用这两个命令，xlsx似乎可以很好地安装在mac上！

Answer 2

我的电脑（Mac OS 10.9.5，Java1.8.0_11，R 3.1.1）也出现了同样的错误。安装Oracle最新的JavaJDK（1.8.0_25）并没有解决这个问题。但是，在更新Java后，安装R 3.1.2为我解决了这个问题。运行install.packages（"rJava"）后，这是有效的：

> library("rJava")
> .jinit() # this starts the JVM
> s <- .jnew("java/lang/String", "Hello World!")
> .jcall(s,"I","length")
[1] 12

请注意，在GUI Java控制面板中更新JDK不同于Java版本，可以通过系统首选项访问。后者只是互联网浏览器插件的JRE。

Answer 3

我做了什么（使用macports R）作为root（sudo bash）：

> < li>

编辑< code >/opt/local/Library/Frameworks/r . framework/Resources/etc/make conf 并更改该行

LIBS =  -llzma -lm -liconv -licuuc -licui18n

自

LIBS =  -llzma -lm -liconv

安装原始的1.6 MacJava

exportJAVA_HOME=/System/Library/JAVA/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents/HOME

运行R CMD javareconf

现在您可以启动R并执行< code > install . packages(" rJava ")。使用1.6版本的Java确保RStudio也可以加载rJava包。

如果不打算使用RStudio，也可以使用Java 1.8