在节点JS中运行命令行管理命令

Question

我无法在NodeJS应用程序中使用< code>exec运行Conda命令。

var conda_path = '~/miniconda3/bin/conda'

var cmd = conda_path + ' init bash & ' + conda_path + ' activate XYZ'
exec(command,
    function(error, stdout, stderr){

    }
);

我收到以下错误：

/bin/sh： /用户/用户名/桌面/存储库/项目/XYZ： 是一个目录

命令未发现错误：您的 shell 未正确配置为使用“conda 激活”。要初始化您的 shell，请运行

$ conda init <SHELL_NAME>

目前支持的shell有：-bash-fish-tcsh-xonsh-zsh-powershell

请参阅“conda init --帮助”以获取更多信息和选项。

重要说明：您可能需要在运行“conda init”后关闭并重新启动 shell。

我在网上找不到关于从NodeJS应用程序运行conda命令的相关信息。

我怎样才能做到这一点？

Answer 1

使用< code >似乎可以工作

我还需要指定conda.sh的路径，它位于/user/username/minicon da？？ /etc/profile.d/中。

此文件可以复制到任何位置，例如NodeJS应用程序的根文件夹。

以下是工作代码：

视窗 10

var commands = [
        'C:\\anaconda\\Scripts\\activate.bat C:\\anaconda',
        'conda activate XYZ_v0_1_env',
        'XYZ arg1  <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>',
    ]

exec(commands.join(' & '),
    function(error, stdout, stderr){
        console.log(error)
        console.log(stdout)
        console.log(stderr)
    }
);

系统

const exec = require('child_process').exec;

var conda_path = __dirname + '/conda.sh'

var commands = [
        conda_path,
        conda_path + ' init',
        conda_path + ' activate XYZ_v0_1_env',
        'XYZ arg1  <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>',
    ]

exec(commands.join(' & '),
    function(error, stdout, stderr){
        console.log(error)
        console.log(stdout)
        console.log(stderr)
    }
);

编辑：使用生成而不是exec来读取进程的实时输出，即生成实时进度：

var commands = [
        'C:\\anaconda\\Scripts\\activate.bat C:\\anaconda',
        'conda activate XYZ_v0_1_env',
        'XYZ arg1  <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>',
    ]

var spawn_ = spawn(commands.join('&'), { shell: true });

spawn_.stdout.on('data', function (data) {
    //do something
});

spawn_.stderr.on('data', function (data) {
    //do something
});

spawn_.on('exit', function (code) {
    //do something
});

Answer 2

Conda提供了conda run命令，用于在环境中执行程序或运行脚本，而无需手动激活它。在您的情况下，您只需要一个命令，例如，

var conda_exec = "C:\\anaconda\\Scripts\\conda.exe"
var env_name = "XYZ"
var sub_cmd = "XYZ arg1 <some_file_input> arg2 arg3 arg4 <some_file_output>"

var command = [conda_exec, 'run', '-n', env_name, sub_cmd].join(" ")

...

请注意，conda 运行当前直到最后才返回 I/O 结果。这意味着您将无法测量执行命令的进度，并且如果您期望获得大量回报（即，不适合内存），则不应使用它。

建议：考虑命名envXYZ_env甚至包括版本控制（例如，XYZ_v0_1_env），这样您就可以区分envXYZ和程序XYZ。