ImageJ固体的计算面积

Question

我有一系列冰的图像，我想通过分析来确定固体和液体的面积。这里有一个示例图像。这类似于孔隙率测量，但由于颜色太相似，无法简单地进行阈值测量，因此我很难进行测量。

目前，我不得不玩弄对比/寻找边缘/去斑/制作二进制文件，以使晶体更容易识别。

然后我通过形态分割：例子和阈值来计算区域。

有没有更简单的方法来计算冰的面积和空间/液体的面积，而不必追踪每一个晶体？

Answer 1

图像的背景照明不均匀，因此进行背景减法是有意义的。而“查找边缘”是一个很好的预处理步骤，可以增强边缘，使形态学分割（这里是一个合理的工具）更容易。

下面是一个示例宏，它自动执行以下许多步骤：

// Perform a background subtraction.
orig = getImageID();
run("Duplicate...", " ");
dupl = getImageID();
run("Gaussian Blur...", "sigma=50");
imageCalculator("Subtract create 32-bit", orig, dupl);

// Enhance the edges.
run("Find Edges");

// Run Morphological Segmentation.
run("Morphological Segmentation");
wait(1000); // HACK
call("inra.ijpb.plugins.MorphologicalSegmentation.segment", "tolerance=20", "calculateDams=true", "connectivity=6");
call("inra.ijpb.plugins.MorphologicalSegmentation.setDisplayFormat", "Catchment basins");
call("inra.ijpb.plugins.MorphologicalSegmentation.createResultImage");

结果图像的每个区域具有不同的实体值：

从那里你可以创建一个直方图（分析）

您可以单击“复制”按钮将整个直方图放入剪贴板，然后将其粘贴到电子表格程序或文本文件中，以便在其他工具中进行分析。

当然还有其他（可能更好）的方法从形态学分割分析集水区“标记”图像；考虑在Image论坛上征求更多的意见和建议。

您可以尝试的另一个简单选项是可培训的Weka细分。