如何标记接触边缘的对象，以便在以后的分析中对其进行不同的处理

Question

我对所有高级ImageJ用户和开发人员都有一个挑战。在我的宏（请参见下面的宏）中，我想插入以下任务：

我正在分析ROI中的粒子和那些接触图片边缘的粒子/对象，我想在结果表的一个特殊列中用“*”标记。也许if句子可以完成任务，但我是一个纯粹的宏初学者，真的需要一些技巧。

（我知道“在边上排除”选项，但我需要这些对象的面积来计算图像上所有面积的总和；但我需要排除它们来计算平均面积）

id = getImageID();
for (i=0 ; i<roiManager("count"); i++) {
    selectImage(id);
    roiManager("select", i);
    run("Analyze Particles...", "size=0.008-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Outlines clear");
}

感谢你的帮助，杰尼

Answer 1

只需分别处理边缘接触和内部粒子。通过对包含所有粒子的图像和排除了接触粒子的图像进行异或运算，可以获得仅包含边缘接触粒子的图像。

此宏将创建三个图像：一个包含所有粒子，一个不包含边缘接触粒子，另一个仅包含边缘接触粒子：

run("Blobs (25K)");
setThreshold(126, 255);
run("Analyze Particles...", "size=0.01-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Masks clear");
rename("all");
run("Analyze Particles...", "size=0.01-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Masks exclude clear");
rename("not touching");
imageCalculator("XOR create", "all","not touching");
rename("touching");

然后，您可以分别分析它们并添加标记：

selectWindow("touching");
run("Analyze Particles...", "size=0.01-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Outlines display clear in_situ");
for(row = 0; row < nResults; row++){
    setResult("touching", row, "*");
}

selectWindow("not touching");
run("Analyze Particles...", "size=0.01-Infinity circularity=0.00-1.00 show=Outlines display in_situ");