从Jython脚本调用Java（ImageJ插件BoneJ）

Question

**抱歉，我对python和java都很陌生，所以我可能不认识到这已经得到了回答，只需要根据我的情况进行调整。

本质上，我有一个在python环境中运行的脚本管理器，我需要将数据传递给bonej插件进行分析，然后该插件将返回一个数组，另一个python脚本将使用该数组进行进一步分析。

我已经被引导到jython来实现这一点，但我不知道如何像导入模块一样导入imageJ。

我知道我可以简单地从命令行打开imagej并引导它分析图像，但这不是我需要的，因为它只是返回骨骼片段的平均值。

基本上，我需要告诉Imagej，它应该分析这段骨头，返回数组，然后是下一段骨头。一个额外的python脚本将数组插入到预定义的背景网格中。

如果有人能从jython那里了解到如何实现这一目标，我将不胜感激。

Answer 1

您确实可以使用Jython调用ImageJ。请参阅斐济wiki上的Jython脚本页面，了解概述和大量示例代码。从ImageJ中开始的一个简单方法是使用脚本编辑器。然后，您可以使用ImageJ启动器[说明]从命令行调用Jython脚本。或者您可以通过将所需的Java库添加到类路径，通过jython可执行文件运行它们。

但要注意：这并不能提供Python库和Java库之间的完全集成。问题是许多Python库都有C代码支持，因此只能从CPython而不是Jython访问它们。例如，非常流行的SciPy和NumPy库不能直接从Jython代码调用。