因此,我正在从NOAA读取站代码csv文件,如下所示:
"USAF","WBAN","STATION NAME","CTRY","FIPS","STATE","CALL","LAT","LON","ELEV(.1M)","BEGIN","END"
"006852","99999","SENT","SW","SZ","","","+46817","+010350","+14200","",""
"007005","99999","CWOS 07005","","","","","-99999","-999999","-99999","20120127","20120127"
前两列包含气象站代码,有时它们的前导零。当熊猫在未指定dtype的情况下导入它们时,它们将变成整数。没什么大不了的,因为我可以遍历数据帧索引并用类似的东西替换它们,”%06d” % i因为它们始终是六位数字,但是您知道…这是懒惰的方式。
使用以下html" target="_blank">代码获取csv:
file = urllib.urlopen(r"ftp://ftp.ncdc.noaa.gov/pub/data/inventories/ISH-HISTORY.CSV")
output = open('Station Codes.csv','wb')
output.write(file.read())
output.close()
一切都很好,但是当我尝试使用此方法阅读时:
import pandas as pd
df = pd.io.parsers.read_csv("Station Codes.csv",dtype={'USAF': np.str, 'WBAN': np.str})
要么
import pandas as pd
df = pd.io.parsers.read_csv("Station Codes.csv",dtype={'USAF': str, 'WBAN': str})
我收到一个讨厌的错误消息:
File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 401, in parser
_f
return _read(filepath_or_buffer, kwds)
File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 216, in _read
return parser.read()
File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 633, in read
ret = self._engine.read(nrows)
File "C:\Python27\lib\site-packages\pandas-0.11.0-py2.7-win32.egg\pandas\io\parsers.py", line 957, in read
data = self._reader.read(nrows)
File "parser.pyx", line 654, in pandas._parser.TextReader.read (pandas\src\parser.c:5931)
File "parser.pyx", line 676, in pandas._parser.TextReader._read_low_memory (pandas\src\parser.c:6148)
File "parser.pyx", line 752, in pandas._parser.TextReader._read_rows (pandas\src\parser.c:6962)
File "parser.pyx", line 837, in pandas._parser.TextReader._convert_column_data (pandas\src\parser.c:7898)
File "parser.pyx", line 887, in pandas._parser.TextReader._convert_tokens (pandas\src\parser.c:8483)
File "parser.pyx", line 953, in pandas._parser.TextReader._convert_with_dtype (pandas\src\parser.c:9535)
File "parser.pyx", line 1283, in pandas._parser._to_fw_string (pandas\src\parser.c:14616)
TypeError: data type not understood
这是一个相当大的csv(3万1千行),所以也许与此有关吗?
这是pandas dtype猜测的问题。
pandas看到数字,然后猜测您希望它是数字。
为了使熊猫不怀疑您的意图,应设置所需的dtype: object
pd.read_csv('filename.csv', dtype={'leading_zero_column_name': object})
会成功的
更新,因为它可以帮助其他人:
要将所有列都设为str,可以执行此操作(根据评论):
pd.read_csv('sample.csv', dtype = str)
要将大多数或选择性的列设为str,可以执行以下操作:
# lst of column names which needs to be string
lst_str_cols = ['prefix', 'serial']
# use dictionary comprehension to make dict of dtypes
dict_dtypes = {x : 'str' for x in lst_str_cols}
# use dict on dtypes
pd.read_csv('sample.csv', dtype=dict_dtypes)
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