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使用CASE WHEN在postgresql中创建数据透视表的正确方法

姚煜
2023-03-14
问题内容

我正在尝试在postgresql中创建数据透视表类型视图,并且快要完成了!这是基本查询:

select 
acc2tax_node.acc, tax_node.name, tax_node.rank 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531';

和数据:

   acc    |          name           |     rank     
----------+-------------------------+--------------
 AJ012531 | Paromalostomum fusculum | species
 AJ012531 | Paromalostomum          | genus
 AJ012531 | Macrostomidae           | family
 AJ012531 | Macrostomida            | order
 AJ012531 | Macrostomorpha          | no rank
 AJ012531 | Turbellaria             | class
 AJ012531 | Platyhelminthes         | phylum
 AJ012531 | Acoelomata              | no rank
 AJ012531 | Bilateria               | no rank
 AJ012531 | Eumetazoa               | no rank
 AJ012531 | Metazoa                 | kingdom
 AJ012531 | Fungi/Metazoa group     | no rank
 AJ012531 | Eukaryota               | superkingdom
 AJ012531 | cellular organisms      | no rank

我想要得到的是以下内容:

acc      | species                  | phylum
AJ012531 | Paromalostomum fusculum  | Platyhelminthes

我正在尝试使用CASE WHEN进行此操作,因此我得到了以下信息:

select 
acc2tax_node.acc, 
CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END as species, 
CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END as phylum 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531';

这给了我输出:

   acc    |         species         |     phylum      
----------+-------------------------+-----------------
 AJ012531 | Paromalostomum fusculum | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | Platyhelminthes
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         | 
 AJ012531 |                         |

现在我知道我必须在某个时候按acc分组,所以我尝试

select 
acc2tax_node.acc, 
CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END as sp, 
CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END as ph 
from 
tax_node, acc2tax_node 
where 
tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531' 
group by acc2tax_node.acc;

但我感到恐惧

ERROR:  column "tax_node.rank" must appear in the GROUP BY clause or be used in an aggregate function

我能够找到的所有先前示例在CASE语句周围都使用了SUM()之类的东西,所以我想那是聚合函数。我尝试使用FIRST():

select 
acc2tax_node.acc, 
FIRST(CASE tax_node.rank WHEN 'species' THEN tax_node.name ELSE NULL END) as sp, 
FIRST(CASE tax_node.rank WHEN 'phylum' THEN tax_node.name ELSE NULL END) as ph 
from tax_node, acc2tax_node where tax_node.taxid=acc2tax_node.taxid and acc2tax_node.acc='AJ012531' group by acc2tax_node.acc;

但得到错误:

ERROR:  function first(character varying) does not exist

谁能提供任何提示?


问题答案:

使用MAX()或MIN(),而不是FIRST()。在这种情况下,每个组值在列中将具有所有NULL,但最多只有一个不为null的值。根据定义,这是该组值的MIN和MAX(排除所有空值)。



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