使用setuptools创建一个调用外部C库的cython软件包

Question

我正在尝试编译，安装和运行一个我们称为的软件包myPackage。它包含一个从库*.pyx调用该函数的文件。当前，当我运行导入包的脚本时，会收到以下错误消息：fftw_set_timelimit()``fftw``clientScript.py

Traceback (most recent call last):
  File "clientScript.py", line 5, in <module>
    import myPackage.myModule
ImportError: /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/myPackage/myModule.so: undefined symbol: fftw_set_timelimit

据我了解（我是python和cython的新手），与C库的链接尚未在我的程序包中执行。实际上，我的setup.py文件如下所示：

from setuptools   import setup,find_packages
from Cython.Build import cythonize
import os

setup(
    name = "myPackage",
    version = "0.0.1",
    url = "none",
    author = "me",
    author_email = "[e-mail]",
    packages=find_packages(),
    ext_modules = cythonize("pyClo/pyClo.pyx"),
)

如您所见，我的setup.py文件使用setuptools。我决定这样做是因为《Python打包用户指南》建议这样做。但是，使用Cython文档中的说明distutils代替。通过调用链接库distutils.Extension('file',['file.pyx'],libraries='fftw')。如何使用获得相同的结果setuptools？

Answer 1

事实证明，setuptools有一个模块setuptools.extension.Extension的使用方式与该distutils.extension.Extension模块相同。

最后，setup.py文件看起来像：

from setuptools import setup, find_packages
from setuptools.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize

extensions = [
    Extension(
        "myPackage.myModule",
        ["myPackage/myModule.pyx"],
        include_dirs=['/some/path/to/include/'], # not needed for fftw unless it is installed in an unusual place
        libraries=['fftw3', 'fftw3f', 'fftw3l', 'fftw3_threads', 'fftw3f_threads', 'fftw3l_threads'],
        library_dirs=['/some/path/to/include/'], # not needed for fftw unless it is installed in an unusual place
    ),
]

setup(
    name = "myPackage",
    packages = find_packages(),
    ext_modules = cythonize(extensions)
)

这是我的安装目录的概述：

.
├── MANIFEST.in
├── myPackage
│   └── myModule.pyx
├── README.rst
└── setup.py

myModule.pyx调用的文件在哪里fftw_set_timelimit()？

MANIFEST.in 包含：

include myPackage/*.*

并且README.rst是纯文本文件。