WSL是WIN10中内置的Linux子系统,WSL2是WSL技术的第二版。今天在WSL2环境中测试Singularity时遇到问题,无法启动sif格式镜像。经分析,原因是内核中没有squashfs文件系统所致。
当前内核版本:
root@DESKTOP-ASI6ES4:~# uname -r
4.19.43-microsoft-standard
错误表现:
root@DESKTOP-ASI6ES4:/opt/singularity# singularity shell busybox_latest.sif
FATAL: container creation failed: mount /proc/self/fd/3/usr/local/var/singularity/mnt/session/rootfs error: can’t mount image /proc/self/fd/3: failed to mount squashfs filesystem: no such device
微软商店获取 Ubuntu(我使用的是16.04), 并运行
wsl.exe --list -v
NAME STATE VERSION
Ubuntu-16.04 Running 2
微软已经在GITHUB上开源了内核代码,GITHUB
sudo install build-essential flex bison libssl-dev libelf-dev
查看 modules.builtin 文件,发现最新代码中已经增加了squashfs支持
kernel/fs/squashfs/squashfs.ko
查看git log,发现是6月14日增加的支持
commit 051a2e8171ec05d9d42035f79b1b207e1fe00e6c
Author: Sasha Levin alexander.levin@microsoft.com
Date: Fri Jun 14 23:07:02 2019 +0000
Update WSL config
Enable squashfs, NF conntrack, etc
TAG_MSFT: wsl
Signed-off-by: Sasha Levin alexander.levin@microsoft.com
所以直接编译
make KCONFIG_CONFIG=Microsoft/config-wsl
编译成功后,项目根目录会产生 vmlinux,把该文件复制到 windows 文件系统中,例如 c:\tmp
cp ./vmlinux /mnt/c/tmp/
WIN10中以管理员身份运行 PowerShell
wsl.exe --shutdown
最新内核版本:
root@DESKTOP-ASI6ES4:/opt/singularity# uname -r
4.19.57-microsoft-standard+
重启ubuntu16.04
wsd.exe -d Ubuntu-16.04
再次运行singularity
root@DESKTOP-ASI6ES4:/opt/singularity# singularity shell busybox_latest.sif
Singularity>
工作正常
WSL2 Announcing: https://devblogs.microsoft.com/commandline/announcing-wsl-2/
WSL2 使用入门: https://linux.cn/article-10972-1.html
Singularity3.3手册: https://sylabs.io/guides/3.3/user-guide/