spark操作Hbase出现cannot access its superclass com.google.protobuf.LiteralByteString异常解决

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最近写了一个Spark程序用来读取Hbase中的数据，我的Spark版本是1.6.1，Hbase版本是0.96.2-hadoop2，当程序写完之后，使用下面命令提交作业：

[[e-mail] $] bin/spark-submit --master yarn-cluster  --executor-memory 4g --num-executors  5  --queue iteblog --executor-cores 2  --class com.iteblog.hbase.HBaseRead --jars spark-hbase-connector_2.10-1.0.3.jar,hbase-common-0.96.2-hadoop2.jar,hbase-server-0.96.2-hadoop2.jar,hbase-client-0.96.2-hadoop2.jar,hbase-protocol-0.96.2-hadoop2.jar,htrace-core-2.04.jar,guava-15.0.jar spark-iteblog-1.0-SNAPSHOT.jar

结果作业运行的时候出现了以下异常

16/11/03 09:45:05 ERROR ApplicationMaster: User class threw exception: org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: java.lang.IllegalAccessError: class com.google.protobuf.HBaseZeroCopyByteString cannot access its superclass com.google.protobuf.LiteralByteString org.apache.hadoop.hbase.DoNotRetryIOException: java.lang.IllegalAccessError: class com.google.protobuf.HBaseZeroCopyByteString cannot access its superclass com.google.protobuf.LiteralByteString   at org.apache.hadoop.hbase.client.RpcRetryingCaller.translateException(RpcRetryingCaller.java:215)   at org.apache.hadoop.hbase.client.RpcRetryingCaller.callWithRetries(RpcRetryingCaller.java:127)   at org.apache.hadoop.hbase.client.RpcRetryingCaller.callWithRetries(RpcRetryingCaller.java:96)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ClientScanner.nextScanner(ClientScanner.java:264)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ClientScanner.initializeScannerInConstruction(ClientScanner.java:169)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ClientScanner.<init>(ClientScanner.java:164)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ClientScanner.<init>(ClientScanner.java:107)   at org.apache.hadoop.hbase.client.HTable.getScanner(HTable.java:720)   at org.apache.hadoop.hbase.client.MetaScanner.metaScan(MetaScanner.java:174)   at org.apache.hadoop.hbase.client.MetaScanner.metaScan(MetaScanner.java:82)   at org.apache.hadoop.hbase.client.HConnectionManager$HConnectionImplementation.isTableAvailable(HConnectionManager.java:911)   at org.apache.hadoop.hbase.client.HBaseAdmin.isTableAvailable(HBaseAdmin.java:1074)   at org.apache.hadoop.hbase.client.HBaseAdmin.isTableAvailable(HBaseAdmin.java:1082)   at com.iteblog.hbase.HBaseRead$.main(HBaseRead.scala:29)   at com.iteblog.hbase.HBaseRead.main(HBaseRead.scala)   at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)   at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:57)   at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)   at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:606)   at org.apache.spark.deploy.yarn.ApplicationMaster$$anon$2.run(ApplicationMaster.scala:542) Caused by: java.lang.IllegalAccessError: class com.google.protobuf.HBaseZeroCopyByteString cannot access its superclass com.google.protobuf.LiteralByteString   at java.lang.ClassLoader.defineClass1(Native Method)   at java.lang.ClassLoader.defineClass(ClassLoader.java:800)   at java.security.SecureClassLoader.defineClass(SecureClassLoader.java:142)   at java.net.URLClassLoader.defineClass(URLClassLoader.java:449)   at java.net.URLClassLoader.access$100(URLClassLoader.java:71)   at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:361)   at java.net.URLClassLoader$1.run(URLClassLoader.java:355)   at java.security.AccessController.doPrivileged(Native Method)   at java.net.URLClassLoader.findClass(URLClassLoader.java:354)   at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:425)   at java.lang.ClassLoader.loadClass(ClassLoader.java:358)   at org.apache.hadoop.hbase.protobuf.RequestConverter.buildRegionSpecifier(RequestConverter.java:910)   at org.apache.hadoop.hbase.protobuf.RequestConverter.buildScanRequest(RequestConverter.java:420)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ScannerCallable.openScanner(ScannerCallable.java:297)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ScannerCallable.call(ScannerCallable.java:157)   at org.apache.hadoop.hbase.client.ScannerCallable.call(ScannerCallable.java:57)   at org.apache.hadoop.hbase.client.RpcRetryingCaller.callWithRetries(RpcRetryingCaller.java:120)   ... 18 more

Google了一下发现这是由于Hbase的Bug导致的（可以参见https://issues.apache.org/jira/browse/HBASE-10304），这个问题的发生是由于优化了 HBASE-9867 （https://issues.apache.org/jira/browse/HBASE-9867）引起的，无意间引进了一个依赖类加载器。它影响使用 -libjars 参数和使用 fat jar两种模式的job，官方对这个Bug的描述：

This is caused by an optimization introduced in HBASE-9867 that inadvertently introduced a classloader dependency.This affects both jobs using the -libjars option and "fat jar," those which package their runtime dependencies in a nested lib folder.

这个Bug影响了 0.96.1 到 0.98.4版本的HBase。对于这个问题的解决，我们可以在运行作业的时候加入比较新的 hbase-protocol jar包到环境变量里面。具体来说如下：

Spark作业解决

如果你是Spark作业，可以通过下面的方法解决上面的问题：

[[e-mail] ~]$ bin/spark-submit --master yarn-cluster --executor-memory 4g --num-executors  5  --queue iteblog --executor-cores 2 --class com.iteblog.hbase.HBaseRead --jars spark-hbase-connector_2.10-1.0.3.jar,hbase-common-0.98.6-hadoop2.jar,hbase-server-0.98.6-hadoop2.jar,hbase-client-0.98.6-hadoop2.jar,hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar,htrace-core-2.04.jar,guava-15.0.jar --conf "spark.driver.extraClassPath=/home/iteblog/hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar"  --conf "spark.executor.extraClassPath=/home/iteblog/hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar" spark-iteblog-1.0-SNAPSHOT.jar

上面通过 spark.driver.extraClassPath 和 spark.executor.extraClassPath 分别在Spark作业的Driver和Exectuor端的环境变量里面引入了 hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar 包。注意，需要把所有hbase-xxx的jar包都换成0.98.x以后的，否则还是会有上述异常问题。当然，如果你觉得上面比较麻烦，你可以把上面的 --conf 配置写入到 $SPARK_HOME/conf/spark-defaults.conf 文件里面，这样就不需要再在提交作业的时候加上了。

Mapreduce作业解决

如果你是在Mapreduce作业中遇到上面的异常，可以通过设置 HADOOP_CLASSPATH 环境变量解决上面的问题，如下：

[[e-mail] ~]$ export HADOOP_CLASSPATH="/home/iteblog/hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar" [[e-mail] ~]$ bin/hadoop --config /home/stack/conf_hadoop/ jar /home/iteblog/hbase-protocol-0.98.6-hadoop2.jar  org.apache.hadoop.hbase.mapreduce.RowCounter hbaseTable   以上是作者的实践，根据作者提供的信息，下面是我的一些具体操作： （1）版本：hadoop2.3.0-cdh5.3.1，hbase0.98..1-cdh5.1.3，jdk1.7（1.8也行，试过，对hadoop没影响，修改hadoop-env.sh），scala2.11.8，spark2.1.3-hadoop2.3 （2）解决过程：找了很多办法，都是说在spark-defaults.conf中指定： spark.driver.extraClassPath  /opt/beh/core/hbase/lib/hbase-protocol-0.98.1-cdh5.1.3.jar  spark.executor.extraClassPath /opt/beh/core/hbase/lib/hbase-protocol-0.98.1-cdh5.1.3.jar 但是对我的情况没有帮助，仍然报同样的错误。 最后找到了本篇文章主人的做法，确认了一件事，这个错是hbase的一个bug，（我的程序虽然报错，但是结果是对的） 然后我就按照他说的下载了hbase-0.98.6-hadoop2-bin.tar.gz，找到里面的lib下的hbase-*.jar，替换掉我的eclipse中的所有hbase0.98..1-cdh5.1.3的hbase-*.jar包，然后再次提交运行程序，解决了这个问题，再次感谢本篇博客的主人的帮助。