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结构MRI、静息态MRI(fMRI)、任务态fMRI、MEG、EEG公开数据库汇总

梁丘洲
2023-12-01

(1)人脑连接组计划(Human Connectome Project, HCP)

该数据库目前被试数约1200人,包括结构MRI、静息态MRI、任务态fMRI、MEG等数据模态,其他数据还包括人口统计学数据、神经心理学数据、基因数据。

网址:http://www.humanconnectome.org/

(2)1000功能连接组计划

1000功能连接组计划(1000 Functional Connectomes Project, FCP),包括结构MRI和静息态fMRI数据,此外还包括人口统计学数据。

网址:http://fcon_1000.projects.nitrc.org/fcpClassic/FcpTable.html

(3)信度与可重复性联盟

神经影像大数据国际“信度与可重复性联盟”(Consortium for Reliability and Reproducibility, CORR)是由中科院心理所和美国儿童心理研究所于2014年共同发起,目前该数据库包含1629名来自不同中心被试的MRI数据,MRI数据模态包括结构MRI、静息态fMRI、dMRI、扩散磁共振成像和动脉自旋标记成像ALS,此外还包括人口统计学数据。

网址:http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/CoRR/html/index.html

(4)DEAP数据库

DEAP数据库主要包括每个被试在面部表情视频刺激下的EEG数据以及心理量表数据。

网址:http://www.eecs.qmul.ac.uk/mmv/datasets/deap/

(5)我的脑连接组计划

我的脑连接组计划(My Connectome Project)只记录了斯坦福大学R. Poldrack教授1个人的大脑在18个月内的各种模态MRI数据(包括结构、静息态、任务态、扩散MRI模态)。

网址:http://myconnectome.org/wp/

(6)中国AD临床前期联盟多中心认知下降纵向研究数据库

中国AD临床前期联盟多中心认知下降纵向研究数据库(SILCODE)主要包括健康人和阿尔兹海默症(AD)患者各个阶段的多模态MRI和PET数据,此外还包括临床与行为学数据。

网址:http://www.alzheimer.org.cn/

(7)OpenfMRI数据库

OpenfMRI数据库包括结构MRI、静息态fMRI、任务态fMRI、扩散MRI、MEG模态,其他数据还包括人口统计学数据、神经心理学数据。

网址:https://openfmri.org/

(8)英国生物银行

英国生物银行(UK Biobank)数据库包括结构MRI、静息态fMRI、任务态fMRI、扩散MRI,此外,还包括人口统计学数据、神经心理学数据、基因数据、血液数据等。

网址:https://www.ukbiobank.ac.uk/

(9)美国国家精神卫生数据档案研究所

美国国家精神卫生数据档案研究所(NDA)数据库包括美国国家自闭症研究数据库(NDAR),与精神疾病相关的国家临床试验数据库(NDCT),研究领域标准数据库(RDoC db)和NIH小儿MRI数据存储库等。从内容上来说,该数据库数据内容丰富,包含临床、影像学,基因组等方面的数据。

网址:https://nda.nih.gov/

(10)神经信息数据库

神经信息数据库(Neuroinformatics database,NIDB)是一个神经影像数据上传和分享的平台,主要包括fMRI和EEG等数据。

网址:https://nda.nih.gov/

(11)OpenNEURO数据库

OpenNEURO数据库数据类型主要包括MRI,MEG,EEG,iEEG和ECoG。

网址:https://openneuro.org/

(12)脑成像图书馆

脑成像图书馆(Brain Image Library, BIL)数据主要类型是哺乳动物全脑体积数据(共聚焦显微镜脑成像数据)。

网址:http://www.brainimagelibrary.org/

(13)ADNI数据库

ADNI数据库,Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI)主要针对AD以及轻度认知障碍患者,数据类型包括MRI和PET图像、遗传学、认知测试、CSF和血液生物标志物等。北美ADNI研究的研究资源和数据可通过该网站获得,其中包括阿尔茨海默氏病患者,轻度认知障碍受试者和老年人对照。

网址:http://adni.loni.usc.edu/

(14)NeuroMorpho,NeuroMorpho主要用于搜集已经出版的研究中的神经元结构,是目前为止最大的3D神经元重建和相关元数据的数据库。

网址:http://adni.loni.usc.edu/

(15)BrainMap,BrainMap是由德克萨斯大学健康科学中心的研究成像研究所负责运营,主要提供功能和结构MRI数据。BrainMap不仅提供用于荟萃分析和数据挖掘的数据,还发布用于定量整合神经影像数据的软件和工具。

网址:http://www.brainmap.org/

(16)分子脑成像中心数据库,分子脑成像中心数据库(The Center for Integrated Molecular Brain Imaging Database)主要提供PET和MRI数据的下载以及Cimbi团队利用这些数据已经发表的文章。

网址:https://cimbi.dk/index.php

(17)OASIS数据库,OASIS(Open Access Series of Imaging Studies)数据库主要针对AD患者,提供正常衰老和AD的纵向MRI神经影像,临床、认知和生物标志物等数据。

网址:http://www.oasis-brains.org/

(18)Delorme脑电数据库,Delorme脑电数据库提供包括认知、癫痫、睡眠等多种EEG/ERP数据。

网址:http://sccn.ucsd.edu/~arno/fam2data/publicly_available_EEG_data.html

(19)Dtmri数据库,Dtmri数据库主要包含人和大鼠的DTI数据。

网址:http://lbam.med.jhmi.edu/

(20)F.M.Kirby Research Center,F.M.Kirby Research Center主要提供多模态的MRI数据,以及相应的软件工具。

网址:http://mri.kennedykrieger.org/databases.html

(21)OMEGA数据库,OMEGA(Open MEG Archive)提供MEG数据,以及包含MRI,人口统计信息和问卷信息以及多模式电生理数据(例如,EEG,细胞记录),

网址:http://www.mcgill.ca/bic/resources/omega

(22)Australian EEG database主要提供EEG/ERP数据,

网址:http://aed.newcastle.edu.au/

(23)CENTRAL脑影像数据库主要包含MRI、PET和CT数据,

网址:https://central.xnat.org

(23)欧洲癫痫数据库(European Epilepsy Database)主要提供癫痫患者连续EEG数据.

网址:http://epilepsy-database.eu/

(25)figshare数据平台

网址:https://figshare.com/

(26)EEGbase

网址:http://eegdatabase.kiv.zcu.cz/

(27)BNCIHorizon 2020

网址:http://bnci-horizon-2020.eu/

(28)PhysioNet数据库

网址:https://physionet.org/

(29)运动影像数据

Left/Right Hand MI: http://gigadb.org/dataset/100295

Motor Movement/Imagery Dataset: https://www.physionet.org/physiobank/database/eegmmidb/

Grasp and Lift EEG Challenge:
https://www.kaggle.com/c/grasp-and-lift-eeg-detection/data

The largest SCP data of Motor-Imagery:
https://doi.org/10.6084/m9.figshare.c.3917698

BCI Competition IV-1:
http://www.bbci.de/competition/iv/#dataset1

BCI Competition IV-2a:
http://www.bbci.de/competition/iv/#dataset2a

BCI Competition IV-2b:
http://www.bbci.de/competition/iv/#dataset2b

High-Gamma Dataset:
https://github.com/robintibor/high-gamma-dataset

Left/Right Hand 1D/2D movements:
https://sites.google.com/site/projectbci/

Imagination of Right-hand Thumb Movement:
https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Planning+Relax

情绪识别数据

DEAP:
http://www.eecs.qmul.ac.uk/mmv/datasets/deap/

Enterface’06:
http://www.enterface.net/results/

Imagined Emotion:
http://headit.ucsd.edu/studies/3316f70e-35ff-11e3-a2a9-0050563f2612

NeuroMarketing:
https://drive.google.com/open?id=0B2T1rQUvyyWcSGVVaHZBZzRtTms

SEED:
http://bcmi.sjtu.edu.cn/~seed/seed.html

SEED-IV:
http://bcmi.sjtu.edu.cn/~seed/seed-iv.html

SEED-VIG:
http://bcmi.sjtu.edu.cn/~seed/seed-vig.html

HCI-Tagging:
https://mahnob-db.eu/hci-tagging/

REGULATION OF AROUSAL:
https://ieee-dataport.org/open-access/regulation-arousal-online-neurofeedback-improves-human-performance-demanding-sensory

误差相关电位(ErrP)

BCI-NER Challenge: https://www.kaggle.com/c/inria-bci-challenge

Monitoring ErrP in a target selection task: http://bnci-horizon-2020.eu/database/data-sets

ErrPs during continuous feedback: https://www-ti.informatik.uni-tuebingen.de/~spueler/eeg_data/contErrP_description.pdf): 10 subjects with 28 EEG electrodes, playing a video game to study execution and outcome error. Dataset Part-1]: https://www-ti.informatik.uni-tuebingen.de/~spueler/eeg_data/Continous_ErrP_dataset_Part1.rar) Dataset Part-2]: https://www-ti.informatik.uni-tuebingen.de/~spueler/eeg_data/Continous_ErrP_dataset_Part2.rar)

HCI-Tagging: https://mahnob-db.eu/hci-tagging/

视觉诱发电位(VEPs)

c-VEP BCI: https://www-ti.informatik.uni-tuebingen.de/~spueler/eeg_data/cVEP_dataset.rar
c-VEP BCI with dry electrodes: https://www-ti.informatik.uni-tuebingen.de/~spueler/eeg_data/dry_cVEP_dataset.rar
SSVEP - Visual Search/Discrimination and Handshake: https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/EEG+Steady-State+Visual+Evoked+Potential+Signals More Dataset: Dataset 2: http://www2.hu-berlin.de/eyetracking-eeg/testdata.html

事件相关电位(ERPs)

Pattern Visual Evoked Potentials: https://www2.le.ac.uk/departments/engineering/research/bioengineering/neuroengineering-lab/software
Face vs. House Discrimination: https://purl.stanford.edu/xd109qh3109

休息状态

Resting State EEG Data: https://dataverse.tdl.org/dataverse/txstatecogelectro
EID-M, EID-S: https://drive.google.com/drive/folders/1t6tL434ZOESb06ZvA4Bw1p9chzxzbRbj

音乐与EEG

Music Imagery Information Retrieval: https://github.com/sstober/openmiir

眨眼/动作

Involuntary Eye Movements during Face Perception: http://www2.hu-berlin.de/eyetracking-eeg/testdata.html
Voluntary-Involuntary Eye-Blinks: https://drive.google.com/file/d/0By5iwWd39NblS2tRWmVTdmRzZUU/view?usp=sharing
EEG-eye state: https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/EEG+Eye+State
EEG-IO: http://gnan.ece.gatech.edu/eeg-eyeblinks/
EEG-VV, EEG-VR: http://gnan.ece.gatech.edu/eeg-eyeblinks/

其他一些数据集

MNIST Brain Digits: http://mindbigdata.com/opendb/index.html
Imagenet Brain: http://www.mindbigdata.com/opendb/imagenet.html
Working Memory: https://github.com/pbashivan/EEGLearn/tree/master/Sample%20data
Deep Sleep Slow Osciallation: https://challengedata.ens.fr/challenges/10
Genetic Predisposition to Alcoholism: https://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/EEG+Database

临床脑电图

TUH EEG Resources: https://www.isip.piconepress.com/projects/tuh_eeg/html/downloads.shtml

其他

https://sccn.ucsd.edu/~arno/fam2data/publicly_available_EEG_data.html - http://headit.ucsd.edu/studies
https://www2.le.ac.uk/departments/engineering/research/bioengineering/neuroengineering-lab/software
https://github.com/pbashivan/EEGLearn/tree/master/Sample%20data
Section 2: https://arxiv.org/pdf/1611.08024.pdf
EEG Databases for Emotion Recognition, NTU
https://engineuring.wordpress.com/2009/07/08/downloadable-eeg-data/
http://www.brainsignals.de/
http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/data/
http://www.brainliner.jp/search/showall/1
http://bnci-horizon-2020.eu/database/data-sets
http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/EEG+Database
https://www.physionet.org/physiobank/database/#neuro
http://www.physionet.org/pn6/chbmit/
https://sites.google.com/site/iitrcsepradeep7/resume
http://memory.psych.upenn.edu/RAM
http://fcon_1000.projects.nitrc.org/indi/cmi_eeg/
https://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=8616018
https://arxiv.org/pdf/1805.06427.pdf
http://www.gtec.at/Research/Biosignal-Data-Sets/content/Biosignal-Data-Sets
http://studycatalog.org/
http://predict.cs.unm.edu/
https://datadryad.org/resource/doi:10.5061/dryad.070jc
https://ieee-dataport.org/data-competitions
The Australian EEG Database https://aed.newcastle.edu.au/AED/login.jsp

注:https://github.com/meagmohit/EEG-Datasets

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