win10安装 graph_tool工具箱
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win10安装 graph_tool工具箱
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前面在win10下搭建ClearMap环境时由于其它问题注释掉了graph_tool工具箱，没有安装，接下来进行单独安装。
参考：
graph_tool官网：https://graph-tool.skewed.de/
https://blog.csdn.net/HUSTHY/article/details/108260470
一般的python包可以用pip install 进行安装，但是graph-tool不能靠像pip这种单纯的python包管理系统来安装。因为它的核心数据结构和算法是用C++写的，因此会有很多C++依赖性（比如依赖Boost, CGAL和expat）。
官网安装教程里说明，windows环境不支持graph_tool的安装，但可以通过Docker或者ubuntu安装，win10系统自带ubuntu，因此我将通过ubuntu18.04来安装graph-tool,其它环境和安装方法可以参考graph-tool官网。
- 配置apt-get的源
- 在sources.list文件中添加以下内容：
deb [ arch=amd64 ] https://downloads.skewed.de/apt bionic main
首先用vim打开sources.list文件，进入insert模式，将上面一行复制到文件最下面，有些可以将vim替换为gedit，但是win10系统自带的ubuntu应用不能识别gedit，所以用vim就可以了。 需要注意的是，上述bionic和ubuntu版本有关，ubuntu8.04对应的是bionic，官网还列出了其它版本的，例如：bullseye, buster, sid, bionic, eoan, focal。
sudo vim /etc/apt/sources.list
2.更新源
apt-get update
3.获取秘钥然后写于系统中
sudo apt-key adv --keyserver keys.openpgp.org --recv-key 612DEFB798507F25
4.安装安装graph-tool
apt-get install python3-graph-tool
此时，安装完成，在python终端输入以下代码验证：
from graph_tool.all import *
此时报出 “ No module named ‘graph_tool’ “错误。
在Ubuntu终端下输入
cd /usr/lib/python3/dist-packages
可以看到该目录下有graph_tool文件夹，然后将graph_tool复制到e盘。
cp -r graph_tool /mnt/e
然后将graph_tool放到环境ClearMap下
from ClearMap.graph_tool.all import *