Database Modeller 是一个用C++编写的简单的数据库建模工具。
本教程通过翻译网站中的实际例子来完成 前提条件: 1>未知蛋白结构的氨基酸序列 2>蛋白的cryo-EM map 步骤一: 找到一个合适的模板,首先将未知序列保存成modeller能够识别的序列文件格式。 其次,利用modeller中已有的分簇好的蛋白序列文件pdb_95.pir来搜索和未知序列相似的蛋白晶体序列。 由于已知的蛋白的序列文件较大,所以需要先将其转换为二进制的形式,具体的代码如下